Ma `lumot

16.5: Mikro-hisobot 4- Komplementatsiya tahlili - Biologiya

16.5: Mikro-hisobot 4- Komplementatsiya tahlili - Biologiya


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Rasm: Ushbu mikro-hisobotning markazidagi rasm - bu haddan tashqari ekspressiv plazmidlar bilan o'zgartirilgan shtammlarning replika plitalari ko'rsatilgan ko'p panelli rasm. Bir nechta panelli raqamlarni qanday o'rnatishni ko'rish uchun Micro-hisobot 1 ko'rsatmalariga qarang.

Materiallar va uslublar: Transformatsiya va takroriy qoplama protseduralari, shuningdek, tajribalarda ishlatiladigan vositalar haqida ma'lumot bering. Iloji bo'lsa, protseduralarga kiritilgan har qanday o'zgarishlarni qayd qilib, laboratoriya qo'llanmasiga murojaat qiling.

Shtammlar va plazmidlar: 1 va 3 mikro-hisobotlarga qarang.

OAV: 1-mikro hisobotga qarang.

Transformatsiya: Natijalaringizni takrorlamoqchi bo'lgan kishi transformatsiya jarayoni haqida batafsil ma'lumotga ega bo'lishi kerak, chunki transformatsiya samaradorligi juda katta farq qiladi va reagentlar va inkubatsiya sharoitlariga kuchli bog'liqligini ko'rsatadi. Siz laboratoriya qo'llanmasiga murojaat qilishingiz mumkin.

Replika qoplamasi: Bu standart protsedura. Siz laboratoriya qo'llanmasiga ham murojaat qilishingiz mumkin.

Natijalar va muhokama: Skanerlangan plitalar bilan sizning raqamingiz ushbu bo'limning asosiy nuqtasidir. Har bir plazmid bilan hisoblangan transformatsiya samaradorligi va o'zgartirilgan shtammlarning (Y/N yoki +/-) turli replika plitalarida o'sish qobiliyatiga ega bo'lgan yagona ma'lumotlar jadvalini qo'shing.Transformatsiya samaradorligi o'zgartirilgan hujayralar / mkg plazmid DNK sonida ifodalanishi kerak.

Ilmiy-tadqiqot bo'limi replika plitalari sizga o'zingiznikini tanlashga qanday imkon bergani haqida hikoya qilishi kerak
Met proteini ikki xamirturush turi o'rtasida saqlanadi. Siz komplementatsiyani kuzatgan yoki kuzatmagan bo'lishingiz mumkin. Komplementatsiyaga rioya qilmaslik eksperimental xato tufayli bo'lishi shart emas. (Qaysi plastinkalar eksperimental xatoga qarshi nazorat vazifasini bajaradi?) Komplementatsiya funksional tahlil boʻlib, sintez oqsilining ifodalanishiga ham, sintez oqsilining Met biosintezidagi reaksiyani katalizlash qobiliyatiga ham bogʻliq. termoyadroviy oqsillar katta C-terminal kengaytmalariga ega, bu ularning normal fermentativ funktsiyalariga ta'sir qilishi mumkin. Ilmiy tushunishni rivojlantirishda salbiy natijalar ijobiy natijalar kabi muhim bo'lishi mumkin.

Agar siz komplementatsiyani kuzatmagan bo'lsangiz, bu sodir bo'lishi mumkin bo'lgan sabablarni muhokama qiling va bu savollarga javob berishga yordam beradigan kelajakdagi tajribalarni taklif qiling. Qo'shimcha tajribalar uchun yangi plazmid konstruktsiyalarini taklif qilishingiz mumkin. Shuningdek, siz BLASTP tahlillaringizdan ma'lumot olishni xohlashingiz mumkin. (E-qiymat nima?) Taklif etayotgan tajribalaringiz foydali maʼlumotlarni taqdim etishi uchun yetarlicha asoslashni kiritganingizga ishonch hosil qiling.


Gari Ruvkun

Massachusets umumiy kasalxonasining molekulyar biologiya bo'limi bosh sahifasi:

Asosiy ilmiy qiziqishlari

mikroRNK va RNK aralashuv mexanizmlari, mikrobioma o'zaro ta'sirining bakterial va hayvonlar genetik tahlili, detoksifikatsiya, immunitet va qarishning neyroendokrin nazorati, boshqa sayyoralardagi hayot.

Akademik traektoriya

1985 yil - hozirgi kunda Garvard tibbiyot maktabi dotsenti, genetika professori
1982 - 1985 Garvard universiteti stipendiyalar jamiyatining kichik xodimi
1982 yil fan nomzodi. Garvard universiteti (biofizika)
1973 yil A.B. Berklidagi Kaliforniya universiteti (biofizika)

2004 Rosenstiel mukofoti, Brandeis universiteti (Viktor Ambros, Endi Fayr, Kreyg Mello bilan)
2008 yil Milliy fanlar akademiyasi
2008 Benjamin Franklin medali, Franklin instituti (Viktor Ambros va Devid Baulkomb bilan)
2008 yil Asosiy tibbiy tadqiqotlar uchun Albert Lasker mukofoti (Viktor Ambros va Devid Baulkomb bilan)
2008 Kanada Gairdner xalqaro mukofoti (Viktor Ambros bilan)
2008 yil Uorren Trienal mukofoti, Massachusets umumiy kasalxonasi (Viktor Ambros bilan)
2009 Luiza Gross Horvits mukofoti, Kolumbiya universiteti (Viktor Ambros bilan)
2009 yil Amerika san'at va fanlar akademiyasi
2009 yil Shaul va Meira Massri mukofoti (Viktor Ambros bilan)
2010 Royale Fans Akademiyasi, Belgique des Lettres va Beaux-Arts des
2009 yil Milliy tibbiyot akademiyasi
2011 yil Den Devid mukofoti (Cynthia Kenyon bilan)
2012 yil Biotibbiy tadqiqotlar uchun Pol Yanssen mukofoti (Viktor Ambros bilan)
2013 yil Ipsen Foundation uzoq umr ko'rish mukofoti
2013 Irving Rayt mukofoti, Amerika Qarish tadqiqotlari jamg'armasi
2014 yil Tibbiyot bo'yicha bo'ri mukofoti (Viktor Ambros bilan)
2014 yil Gruber genetika mukofoti (Viktor Ambros va Devid Baulkomb bilan)
Hayot fanlari bo'yicha 2015 yilgi yutuqlar mukofoti (Viktor Ambros bilan)
Rivojlanish biologiyasi bo'yicha 2016 yil marti Dimes mukofoti (Viktor Ambros bilan)
2019 Amerika falsafiy jamiyati

Professional faoliyat

2004 yil - Garvard hayotning kelib chiqishi tashabbusi
2006 yil - hozirgi Keng institut dotsenti
2015 yil - hozirgi Raisi, Ilmiy tekshirish qo'mitasi, Biotibbiyot tadqiqotlari bo'yicha Smit oilasi mukofotlari dasturi
2015 yil - hozirgi Pol Glenn tibbiyot fondi ilmiy maslahat kengashi
2018 yil - hozirgi Kaliforniya Life Sciences Company (Calico) Ilmiy maslahat kengashi

O'tgan
2003 - 2011 Garvard mikrobial fanlar tashabbusi tashkiliy qo'mitasi
2004 - 2007 NIH Qarish bo'yicha Milliy maslahat kengashi
2012 - 2014 Ellison Medical Foundation Ilmiy maslahat kengashi
2015 Vallee Foundation tashrif professori
2012 - 2017 NAS Koinot tadqiqotlari kengashi, Astrobiologiya va sayyora fanlari qo'mitasi
2017 - 2018 NAS Koinot tadqiqotlari kengashi, sayyoralarni himoya qilish siyosatini ishlab chiqish jarayonlarini ko'rib chiqish
2015 – 2019 Milliy Fanlar akademiyasining Genetika bo‘limi mudiri
2018 - 2019 NASA Mars namunasini qaytarish sterilizatsiyasi ishchi guruhi, reaktiv harakat laboratoriyasi, Caltech

Faxriy taklif qilingan ma'ruzalar

1998 yil Nippon telefon va telegraf fanlari forumi ommaviy ma'ruzasi, Tokio
2003 Harvi Rokfeller universiteti o'qituvchisi
2008 yil Jan Mitchell Uotson ma'ruzasi, Chikago universiteti
2012 Mendel tavalludining 190 yilligi simpoziumi, Brno, Chexiya
2013 Double Helix, Cold Spring Harborning 60 yilligi

Bibliografiya

1. Ruvkun G, Ausubel FM 1980 Nitrogenaza genlarining turlararo homologiyasi. Proc. Natl. akad. Sci. AQSh 77: 191-195. PMCID: PMC348234

2. Ruvkun G, Ausubel FM 1981. Prokaryotlarda saytga yo'naltirilgan mutagenezning umumiy usuli. Tabiat 289: 85-88. PMID: 6256652

3. Ruvkun G, Long, SR, Meade, HM, Ausubel, FM 1981. Simbiotik azot fiksatsiyasining molekulyar genetikasi. Sovuq bahor bandargohida miqdoriy biologiya bo'yicha simpozium 45: 492-500.

4. Meade HM, Long SR, Ruvkun G, Brown SE, Ausubel FM 1982. Transpozon Tn5 mutagenezi bilan qo'zg'atilgan Rhizobium meliloti simbiotik va auksotrofik mutantlarining fizik va genetik tavsifi. J Bakteriol 149: 114-122. PMCID: PMC216598

5. Ruvkun G, Sundaresan V, Ausubel FM 1982. Nukleotidlarning maxsus himoyasi lak DNaz I ni dimetil sulfat (DMS) metilatsiyasidan olingan operator, xom bakterial ekstraktlar yordamida. Gen 18: 245-255. PMID: 6290328

6. Ruvkun G, Sundaresan V, Ausubel FM 1982. Yo'naltirilgan transpozon Tn5 mutagenezi va komplementatsiya tahlili Rhizobium meliloti simbiotik azot fiksatsiyasi (nif) genlar. 29-uya: 551-559. PMID: 6288262

7. Ruvkun G, Long SR, Meade HM, van den Bos RC, Ausubel FM 1982. ISRml: a Rhizobium meliloti azot fiksatsiyasi (nif) genlariga afzallik bilan o'tadigan kiritish ketma-ketligi. J Mol Appl Genet 1: 405-418. PMID: 6296251

8. Finney M, Ruvkun, G va Horvitz, HR 1988. The Caenorhabditis elegans hujayra nasl-nasabi va differentsiatsiya geni unc-86 gomeodomain va sutemizuvchilarning transkripsiya omillariga o'xshashligini o'z ichiga olgan oqsilni kodlaydi. 55-uya: 757-769. PMID: 2903797

9. Herr W, Sturm, RA, Clerc, RG, Corcoran, LM, Baltimore, D, Sharp, PA, Ingraham, HA, Rosenfeld, MG, Finney, M, Ruvkun, G, and Horvitz, HR 1988 POU domeni: sutemizuvchilar chuquridagi katta saqlanib qolgan hudud - 1, 1-oktabr, 2-oktabr va Caenorhabditis elegans unc-86 gen mahsulotlari. Genlar va rivojlanish 2: 1513-1516. PMID: 3215510

10. Ruvkun G, Ambros, V, Coulson, A, Waterston, R, Sulston, J, va Horvitz, HR, 1989. Molekulyar genetika. Caenorhabditis elegans geteroxronik gen lin-14. Genetika 121: 501-516. PMCID: PMC1203636

11. Ruvkun G va Giusto, J 1989 The Caenorhabditis elegans heteroxronik gen lin-14 rivojlanish jarayonida vaqtinchalik kalitni tashkil etuvchi yadro oqsilini kodlaydi. Tabiat 338: 313-319. PMID: 2922060

12. Burglin TR, Finney, M, Coulson, A va Ruvkun, G 1989. C. elegans gomeobox o'z ichiga olgan ko'plab genlarga ega. Tabiat 341: 239-243. PMID: 2571091

13. Ruvkun G, Gilbert, V, Horvitz, HR 1990. Butun genom Janubiy Xoch gibridizatsiyasi yordamida mutatsiyalar va DNK polimorfizmlarini aniqlash. Nuklein kislotalari tadqiqoti 18: 809-815. PMCID: PMC330331

14. Finney M va Ruvkun, G 1990. The unc-86 gen mahsuloti hujayra nasl-nasabini va hujayra o'ziga xosligini birlashtiradi Caenorhabditis elegans. 63-uya: 895-905. PMID: 2257628

15. Wightman B, Burglin, TR, Gatto, J, Arasu, P, G Ruvkun 1991. Salbiy tartibga soluvchi ketma-ketliklar lin-14 Vaqtinchalik kalitni yaratish uchun 3' tarjima qilinmagan mintaqa zarur C. elegans rivojlanish. Genlar va rivojlanish 5: 1813-1824. PMID: 1916264

16. Arasu P, Wightman, B, G Ruvkun 1991. Vaqtinchalik tartibga solish lin-14 boshqa ikkita geteroxronik genning antagonistik ta'siri bilan, lin-4 va lin-28. Genlar va rivojlanish 5: 1825-1833. PMID: 1916265

17. Ruvkun G, Wightman, B, Burglin, TR va P Arasu. 1991. Mutatsiyalarning noto'g'ri tartibga solinishiga olib keladigan funktsiya mutatsiyalarining dominant daromadi C. elegans geteroxronik gen lin-14va naqsh hosil qiluvchi genlardagi dominant mutatsiyalarning evolyutsion oqibatlari. Rivojlanish (Qo'shimcha): 47‑54. PMID: 1742500

18. Burglin TR, Ruvkun, G, Coulson, A, Hawkins, N, McGhee, J, Schaller, D, Wittmann, C, Myuller, F va Waterston, R 1991. Nematod homeobox klasteri. Tabiat 351: 703. PMID: 1676487

19. Miller D, Shen, M, Shamu, C, Burglin, T, Ruvkun, G, Ghee, M Dubois, L Wilson 1992 yil C. elegans unc-4 gen ma'lum motor neyronlariga sinaptik kirish naqshini aniqlaydigan homeodomain oqsilini kodlaydi. Tabiat 355: 841-845. PMID: 1347150

20. Xue DM, Finney, M, Ruvkun, G va M Chalfie 1992 yil. ni tartibga solish mec-3 tomonidan gen C. elegans gomeoproteinlar Unc-86 va Mec-3. EMBO J. 11: 4969-4979. PMCID: PMC556975

21. Burglin TR va G Ruvkun 1992. PBX genlarida yangi motif. Nature Genet 1: 319-320. PMID: 1363814

22. Wightman B, I Ha va G Ruvkun 1993. Geteroxronik genning transkripsiyadan keyingi regulyatsiyasi lin-14 tomonidan lin-4 vaqtinchalik naqsh shakllanishiga vositachilik qiladi C. elegans. 75-uya: 855-862. PMID: 8252622

23. Gottlieb S va G Ruvkun 1994 yil. daf-2, daf-16, daf-23: dauer shakllanishini nazorat qiluvchi genetik jihatdan o'zaro ta'sir qiluvchi genlar C. elegans. Genetika 137: 107-120. PMCID: PMC1205929

24. Greenstein D, Hird, S Plasterk, R, Andachi, Y, Kohara, Y, Wang, B, Finney, M, and G Ruvkun 1994. Maqsadli mutatsiyalar. C. elegans POU-homeobox geni cheh-18 oosit hujayralari siklini to'xtatish, jinsiy bezlar migratsiyasi va epidermal differentsiatsiyada nuqsonlarni keltirib chiqaradi. Genlar va rivojlanish 8: 1935-1948. PMID: 7958868

25. Baumeister R, Liu, Y, and G Ruvkun 1996. Naslning o'ziga xos regulyatorlari hujayra naslining assimetriyasini transkripsiyaga bog'laydi. Caenorhabditis elegans POU geni unc-86 neyrogenez davrida. Genlar va rivojlanish 10: 1395-1410. PMID: 8647436

26. Morris JZ, Tissenbaum, HA va G Ruvkun 1996. Uzoq umr ko'rish va diapauzani tartibga soluvchi fosfatidilinositol-3-OH kinaz oilasi a'zosi. Caenorhabditis elegans. Tabiat 382: 536-538. PMID: 8700226

27. Barnes TM, Jin, Y, Horvitz, HR, Ruvkun, G va S Hekimi 1996 yil. The C. elegans xulq-atvor gen unc-24 7.2 eritrotsitlar bandiga (stomatin) va o'ziga xos bo'lmagan lipidlarni o'tkazuvchi oqsilga o'xshash yangi ikki tomonlama oqsilni kodlaydi. J. neyrokimyosi 67: 46-57. PMID: 8667025

28. Ha I, Wightman, B va G Ruvkun 1996. A bo'rtib ketgan lin-4/lin-14 uchun RNK dupleksi etarli Caenorhabditis elegans lin-14 vaqtinchalik gradient shakllanishi. Genlar va rivojlanish 10: 3041-3050. PMID: 8957004

29. Sze JY, Liu, Y va G Ruvkun 1997. VP16-faollashtirish C. elegans Neyron spetsifikatsiyasi transkripsiya faktori UNC-86 quyi oqim genlaridagi mutatsiyalarni bostiradi va asab migratsiyasi va akson o'sishida nuqsonlarni keltirib chiqaradi. Rivojlanish 124: 1159-1168. PMID: 9102303

30. Sluder AE, Lindblom, T va G. Ruvkun 1997. Caenorhabditis elegans orfan yadro gormoni retseptorlari geni nhr-2 erta embrion rivojlanishida ishlaydi. Rivojlanish biologiyasi 184: 303-319. PMID: 9133437

31. Hobert O, Mori, I, Yamashita, Y, Honda, H, Ohshima, Y, Liu, Y va G Ruvkun 1997. Neyronlararo funktsiyani tartibga solish C. elegans tomonidan termoregulyatsiya yo'li ttx-3 LIM homeobox geni. Neyron 19: 345-357. PMID: 9292724

32. Patterson G I, Koweek, A, Vong, A, Liu, Y, and G Ruvkun 1997. DAF-3 Smad oqsili TGF-beta bilan bog'liq retseptor signalizatsiyasini antagonize qiladi. C. elegans dauer yo'li. Genlar va rivojlanish 11: 2679-2690. PMCID: PMC316611

33. Kimura KD, Tissenbaum, HA, Liu, Y va G Ruvkun 1997 yil. daf-2, uzoq umr ko'rish va diapauzani tartibga soluvchi insulin retseptoriga o'xshash gen C. elegans. Fan 277: 942-946. PMID: 9252323

34. Ogg S, Paradis, S, Gottlieb, S, Patterson, GI, Li, L, Tissenbaum, HA va G Ruvkun 1997. Fork boshi transkripsiya omili DAF-16 insulinga o'xshash metabolik va uzoq umr ko'rish signallarini uzatadi. C. elegans. Tabiat 389: 994-999. PMID: 9353126

35. Tissenbaum HA va G Ruvkun 1998. Insulinga o'xshash signalizatsiya yo'li ham uzoq umr ko'rishga, ham ko'payish jarayoniga ta'sir qiladi. C. elegans. Genetika 148: 703-717. PMCID: PMC1459840

36. Hobert O, Liu, Y, D'Alberti, T va G Ruvkun 1998. LIM homeobox geni tomonidan termoregulyatsiya tarmog'ida neyron rivojlanishi va funktsiyasini nazorat qilish lin-11. J. Neuroscience 18: 2084-2096. PMID: 9482795

37. Paradis S va G Ruvkun 1998 yil. Caenorhabditis elegans Akt/PKB insulin retseptorlariga o'xshash signallarni AGE-1 PI3 kinazdan DAF-16 transkripsiya faktoriga o'tkazadi. Genlar va rivojlanish 12: 2488-98. PMCID: PMC317081

38. Ruvkun G va O Xobert 1998. Rivojlanishni nazorat qilish taksonomiyasi Caenorhabditis elegans. Fan 282: 2033-41. PMID: 9851920

39. Ogg S va G Ruvkun 1998. The C. elegans PTEN homologi DAF-18 insulin retseptorlariga o'xshash metabolik signalizatsiya yo'lida ishlaydi. Mol hujayra 2: 887-93. PMID: 9885576

40. Hobert O va G Ruvkun 1998. Filogeniya bo'ylab LIM homeobox geni funktsiyasi uchun umumiy mavzu? Biol. Buqa. 195: 377-80. PMID: 9924780

41. Slack F va G Ruvkun 1998. Ko'pincha RING barmoq va B-box motiflari bilan bog'langan yangi takroriy domen. Trends Biochem Sci 23:474-5. PMID: 9868369

42. Hobert O, Moerman DG, Clark KA, Beckerle MC, and G Ruvkun 1999. Mushaklar biriktiruvchi birikmalar yaxlitligi va mexanosensorial funktsiyaga ta'sir qiluvchi konservalangan LIM oqsili. Caenorhabditis elegans. J Cell Biol 144: 45-57. PMCID: PMC2148118

43. Hobert O, Tessmar K va G Ruvkun 1999. The C. elegans lim-6 LIM homeobox geni neyritlarning o'sishini va ma'lum GABAergik neyronlarning funktsiyasini tartibga soladi. Rivojlanish 126, 1547-1562. PMID: 10068647

44. Paradis S, Ailion, M, Toker A, Thomas, JH, and G Ruvkun 1999. Diapauzani tartibga soluvchi AGE-1 PI3 kinaz signallarini uzatish uchun PDK1 homologi zarur va yetarli. C. elegans. Genlar va rivojlanish 13: 1438-1452. PMCID: PMC316759

45. Sagasti A, Hobert O, Troemel ER, Ruvkun G, Bargmann CI 1999. Muqobil olfaktör neyron taqdirlari LIM homeobox geni lim-4 tomonidan belgilanadi. Genes Dev 13: 1794-80. PMCID: PMC316880

46. ​​Tissenbaum HA Hawdon, J, Perregaux, M, Hotez, P, Guarente, L va G Ruvkun 2000. Uzoqdan bog'liq bo'lgan nematod turlarida diapauzani tiklash uchun umumiy muskarin yo'li Caenorhabditis elegans va Ancylostoma caninum. Proc. Natl. akad. Sci. 97: 460-465. PMCID: PMC26685

47. Sze JY, Viktor, M, Loer, C, Shi, Y va G Ruvkun 2000. Oziq-ovqat va metabolik signalizatsiya nuqsonlari C. elegans serotonin-sintez mutant, Tabiat 403: 560-4. PMID: 10676966

48. Reinhart BJ, Slack, FA., Basson, M, Pasquinelli, AE, Bettinger, JC, Rougvie, AC, Horvitz, HR, and G Ruvkun 2000. 21 nukleotid ruxsat - 7 RNK rivojlanish vaqtini tartibga soladi C. elegans. Tabiat, 403: 901 - 906. PMID: 10706289

49. Slack FJ, Basson, M, Liu, Z, Ambros, V, Horvitz, HR, and G Ruvkun 2000. The lin-41 RBCC geni ta'sir qiladi C. elegans orasidagi geteroxronik yo'l ruxsat - 7 tartibga soluvchi RNK va lin-29 transkripsiya omili. Mol. 5-uya: 659-69. PMID: 10882102

50. Kagoshima H, Sommer, R, Reynhart, B, Ruvkun, G, Kassata, G va TR Burglin 2000. Darajali ifoda cheh-14 gipodermisdagi muxbirlar gonadal signal bilan qo'zg'atiladi. Rivojlanish genlari va evolyutsiya 210: 564-569. PMID: 11180807

51. Nasrin N, Ogg, S, Keyxill, C, Biggs, U, Nui, S, Dore, J, Kalvo, D, Shi, Y, Ruvkun, G va M Aleksandr-Bridges 2000. DAF-16 CREBni ishga oladi. - HepG2 hujayralarida insulinga o'xshash o'sish omilini bog'laydigan protein 1 promotoriga bog'lovchi oqsil koaktivatori kompleksi. Proc. Natl. akad. Sci., 97: 10412-7. PMCID: PMC27038

52. Pasquinelli A, Reynhart, B, Slack F, Maller, B, Kuroda, M, Martindale, M, Srinivasan, A, Fishman, M, Hayward D, Ball E, Degnan, B, Myuller, P, Spring, J, Finnerty, J, Corbo, J, Levine, M, Leahy, P, Davidson, E, and G Ruvkun 2000. Ketma-ketlikni saqlash va vaqtinchalik ifoda. ruxsat - 7 geteroxronik tartibga soluvchi RNK. Tabiat 408: 86-89. PMID: 11081512

53. Wolkow CA, Kimura, KD, Lee, M and G Ruvkun 2000. Regulation C. elegans asab tizimidagi insulinga o'xshash signal orqali umr ko'rish. Fan 290:147-50. PMID: 11021802

54. Cahill CM, Tzivion, G, Nasrin, N, Ogg, S, Dore, J, Ruvkun, G, and M Alexander-Bridges 2001. Fosfatidilinositol 3-kinaz signalizatsiyasi DAF-16 DNK ulanishini inhibe qiladi va 14-3- orqali ishlaydi. 3-bog'liq va 14-3-3-mustaqil yo'llar. J. Biol. Kimyo. 276: 13402-10. PMID: 11124266

55. Reynhart BJ va G Ruvkun 2001. Izoformga xos mutatsiyalar Caenorhabitis elegans geteroxronik gen lin-14 bosqichga xos naqshga ta'sir qiladi. Genetika 157: 199-209. PMCID: PMC1461488

56. Burglin TR va G Ruvkun 2001. Ektodermal va ekskretor hujayralar funktsiyasini tartibga solish C. elegans POU homeobox geni cheh-6 Rivojlanish 128: 779-790. PMID: 11171402

57.Pirs SB, Kosta, M, Wisotzkey, R, Devadhar, S, Homburger, SA, Buchman, AR, Fergyuson, KC, Heller, J, Platt, DM, Liu, LX, Pasquinelli, AE, Dobershteyn, SK, G Ruvkun 2001 Inson insulini bilan DAF-2 retseptorlari signalizatsiyasini tartibga solish va ins-1, noodatiy katta va xilma-xil a'zosi C. elegans insulin genlari oilasi. Genlar va rivojlanish 15: 672-686. PMCID: PMC312654

58. Grishok A, Pasquinelli, AE, Conte, D, Li, N, Parrish, S, Ha, I, Baillie, DL, Fire, A, Ruvkun, G, and Mello, CC 2001. RNK aralashuvi bilan bog'liq genlar va mexanizmlar boshqaruvchi kichik temporal RNKlarning ifodasini tartibga soladi Caenorhabditis elegans rivojlanish vaqti. 106-uya: 23-34. PMID: 11461699

59. Li RYN, Hench, J va G Ruvkun 2001. Regulyatsiya C. elegans DAF-16 va uning inson ortologi FKHRL1 tomonidan daf-2 insulinga o'xshash signalizatsiya yo'li. Curr Biol. 11: 1950-1957 yillar. PMID: 11747821

60. Sze JY, Chjan, S, Li, J va G Ruvkun 2002. The C. elegans POU-domen transkripsiya faktori UNC-86 ni tartibga soladi tph-1 triptofan gidroksilaza geni va o'ziga xos serotonerjik neyronlarda neyrit o'sishi. Rivojlanish, 129:3901-11. PMID: 12135927

61. Ruvkun G, M Finney, G Church, M Zuber, V Gilbert 2002. Hayot belgilarida boshqa sayyoralarda DNKga asoslangan hayot uchun robot-PCR detektori: 2000 yil aprel oyida hayotni aniqlash texnikasi bo'yicha seminarga asoslangan hisobot. Kosmik fanlar kengashi, NASA.

62. Wolkow CA, Munoz MJ, Riddle DL, G Ruvkun 2002. Insulin retseptorlari substrati va p55 ortologik adapter oqsillari hujayrada ishlaydi. Caenorhabditis elegans daf-2/insulinga o'xshash signalizatsiya yo'li. J Biol Chem. 277:49591-7. PMID: 12393910

63. Li SS, Li, RY, Fraser, AG, Kamath, RS, Ahringer, J va G Ruvkun 2002. Tizimli RNK ekrani mitoxondriyalarning muhim rolini aniqlaydi. C. elegans uzoq umr ko'rish. Tabiat genetikasi, 33:40-8. PMID: 12447374

64. Ashrafi K, Chang, FY, Watts, JL, Fraser, AG, Kamath, RS, Ahringer, J and G Ruvkun 2003. Genom bo'yicha RNK tahlili. C. elegans yog'ni tartibga soluvchi genlar. Tabiat, 421:268-72. PMID: 12529643

65. Li V va G Ruvkun 2003 yil. daf-28 kodlaydi a C. elegans Atrof-muhit ko'rsatkichlari bilan tartibga solinadigan va DAF-2 signalizatsiya yo'lida ishlaydigan insulin superoilasi a'zosi. Genlar va rivojlanish, 17: 844-58. PMCID: PMC196030

66. Bashirulloh A, Pasquinelli, AE Kiger, A, Perrimon, N, Ruvkun, G va CS Thummel 2003. Drosophila metamorfozining boshlanishida kichik temporal RNKlarni muvofiqlashtirish. Rivojlanish biologiyasi, 259: 1-8. PMID: 12812783

67. Pasquinelli AE, McCoy, A Ximenez, E Salo, G Ruvkun, M Martindale va J Baguña 2003 yil. 22 nukleotidning ifodalanishi ruxsat - 7 Metazoa bo'ylab heteroxronik RNK: hayot tarixi evolyutsiyasidagi roli? Evolyutsiya va rivojlanish, 5: 372-378. PMID: 12823453

68. Aspöck G, G Ruvkun va T Burglin 2003. The Caenorhabditis elegans ems sinfidagi homeobox geni cheh-2 M3 farenks motoneyron funktsiyasi uchun talab qilinadi. Rivojlanish, 130: 3369-3378. PMID: 12810585

69. Li SS, Kennedi, S, Tolonen, AC va G Ruvkun 2003. Boshqaruvchi DAF-16 maqsadli genlar C. elegans hayot davomiyligi va metabolizm. Fan. 300:644-7. PMID: 12690206

70. Grad Y, Aach, J, Hayes, GD, Reinxart, B, Church, GM, Ruvkun, G va J Kim. 2003. Hisoblash va eksperimental identifikatsiya C. elegans mikroRNKlar. Molekulyar hujayra, 11: 1253-63. PMID: 12769849

71. Garsin DA. JM Villanueva, J Begun, DH Kim, CD Sifri, SB Calderwood, G Ruvkun va FM Ausubel 2003. Uzoq umr ko'rgan Caenorhabditis elegans daf-2 mutantlar bakterial patogenlarga chidamli, Science, 300:1921. PMID: 12817143

72. Ruvinskiy I va G Ruvkun 2003. Uzoq turlar o'rtasida kuchaytirgichni saqlashning funktsional sinovlari, Rivojlanish, 130: 5133-42. PMID: 12944426

73. Sze JY va G Ruvkun 2003. Faoliyati Caenorhabditis elegans UNC-86 POU transkripsiya omili hid sezuvchanligini modulyatsiya qiladi, Proc. Natl. akad. Sci., 100: 9560-5. PMCID: PMC170957

74. Kim J, Krichevsky, A, Grad, Y, Hayes, GD, Kosik, KS, Church, GM, and G Ruvkun 2004. Sutemizuvchilar neyronlarida poliribosomalar bilan tozalanadigan ko'plab mikroRNKlarni aniqlash. Proc. Natl. akad. Sci.101: 360-5. PMCID: PMC314190

75. Kennedi SK, D Vang va G Ruvkun 2004. Saqlangan siRNKni buzuvchi RNaz RNK aralashuvini salbiy tartibga soladi. C. elegans. Tabiat 427: 645-9. PMID: 14961122

76. Tewari M, Xu PJ, Ahn JS, Ayivi-Guedehoussou N, Vidalain PO, Li S, Milshteyn S, Armstrong CM, Boxem M, Butler MD, Busiguina S, Rual JF, Ibarrola N, Chaklos ST, Bertin N, Vaglio P, Edgley ML, King KV, Albert PS, Vandenhaute J, Pandey A, Riddle DL, Ruvkun G, Vidal M 2004. Tizimli interaktom xaritalash va genetik buzilish tahlili. C. elegans TGF-beta signalizatsiya tarmog'i. Molekulyar hujayra 13: 469-82. PMID: 14992718

77. Mak HY va G Ruvkun 2004. Reproduktiv rivojlanishning hujayralararo signalizatsiyasi. C. elegans DAF-9 sitoxrom P450. Rivojlanish, 131: 1777-86. PMID: 15084462

78. Mansfield JH, Harfe BD, Nissen R, Obenauer J, Srineel J, Chaudhuri A, Farzan-Kashani R, Zuker M, Pasquinelli AE, Ruvkun G, Sharp PA, Tabin CJ, McManus MT 2004. MikroRNKga javob beruvchi "sensor" transgenlari. Hoxga o'xshash va umurtqali mikroRNK ifodasining boshqa rivojlanishi bilan tartibga solinadigan naqshlari. Nat Genet. 36:1079-83. PMID: 15361871

79. Vang D va G Ruvkun 2004. Insulin yo'li RNKni tartibga soladi. C. elegans. Miqdoriy biologiya bo'yicha Cold Spring Harbor simpoziumi, 69-nashr, 69: 429-433.

80. Kim JK, HW Gabel, RS Kamath, M Tevari, A Pasquinelli, S Kennedi, M Dybbs, N Bertin, M Vidal, JM Kaplan va G Ruvkun 2005. RNK aralashuvining funktsional genomik tahlili. C. elegans. Fan 308: 1164-7. PMID: 15790806

81. Efimenko E, Bubb K, Mak HY, Holzman T, Leroux MR, Ruvkun G, Tomas JH, Svoboda P 2005. Tahlil. xbx genlar C. elegans. Rivojlanish. 132:1923-34. PMID: 15790967

82. Hamilton B, Y Dong, M Shindo, W Liu, G Ruvkun va SS Lee 2005. Uzoq umr ko'rish genlari uchun tizimli RNK ekrani. C. elegans. Genlar va rivojlanish 19: 1544-55. PMCID: PMC1172061

83. Sieburth D, Q Chng, M Dybbs, M Tavazoie, S Kennedy, D Wang, D Dupuy, J Rual, D Hill, M Vidal, G Ruvkun, and J Kaplan 2005. Sinaps tuzilishi uchun zarur bo'lgan genlarni tizimli tahlil qilish va funktsiyasi. Tabiat 436: 510-517. PMID: 16049479

84. Vang DS, S Kennedi, D Konte, J Kim, H Gabel, R Kamath, C Mello va G Ruvkun 2005. Germline P granulalarining somatik noto'g'ri ifodasi va Retinoblastoma yo'li mutantlarida kuchaytirilgan RNK aralashuvi. Tabiat 436: 593-597. PMID: 16049496

85. Frand AR, S Russel, G Ruvkun 2005. Funktsional genomik tahlil. C. elegans eritish. PLoS Biol. 2005 yil 3 oktyabr (10): e312. doi: 10.1371/journal.pbio.0030312. Epub 2005 yil 30-avgust.PMID: 16122351

86. Duchaine TF, JA Wohlschlegel, S Kennedi, Y Bei, D Conte, K Pang, DR Brownell, S Harding, S Mitani, G Ruvkun, JR Yates, and CC Mello 2006. Funktsional proteomika biokimyoviy joyni ochib beradi. C. elegans DCR-1 bir nechta kichik RNK vositachiligidagi yo'llarda. 124-uya: 343-54. PMID: 16439208

87. Mak HY, LS Nelson, M Basson, CD Jonson va G Ruvkun 2006. Poligenik nazorat. C. elegans yog 'saqlash. Tabiat genetikasi 38:363-8. PMID: 16462744

88. Sandoval GM, JS Duerr, J Hodgkin, JB Rand va G Ruvkun 2006. Vesikulyar atsetilxolin tashuvchisi VAChT/UNC-17 va sinaptobrevin/SNB-1 o'rtasidagi genetik o'zaro ta'sir C. elegans. Tabiat nevrologiyasi, 9: 599-601. PMID: 16604067

89. Xu PJ, J Xu va G Ruvkun 2006. Ikkita membrana bilan bog'langan tirozin fosfataza homologlari kuchayadi C. elegans AKT-1/PKB signalizatsiyasi. PLoS Genet. 2006 yil 2 iyul (7): e99. PMCID: PMC1487177

90. Hayes GD, AR Frand va G. Ruvkun 2006. The mir-84 va ruxsat - 7 ning paralog mikroRNK genlari Caenorhabditis elegans konservalangan yadroviy gormon retseptorlari NHR-23 va NHR-25 orqali eritishni to'xtatishga yo'naltiradi. Rivojlanish 133: 4631-4641. PMID: 17065234

91. Ruvinskiy I, U Ohler, CB Burge va G Ruvkun 2006. Keng ifodalangan neyron genlarini aniqlash. C. elegans. Dev Biol. 302: 617-26. PMID: 17046742

92. Hayes GD va G Ruvkun 2006. Noto'g'ri ifodalash C. elegans miRNK keling‑7 rivojlantirish dasturlarini boshqarish uchun etarli. Cold Spring Harbor Symp Quant Biol. 71: 21-7. Regulyatsiya qiluvchi RNKlar. PMID: 17381276

93. Curran SP va G Ruvkun 2007. Hayotiylik uchun zarur bo'lgan evolyutsion tarzda saqlanib qolgan genlar tomonidan umr ko'rish davomiyligini tartibga solish. PloS Genetika 3(4):e56. PMCID: PMC1847696

94. Kim N, Dempsey C, Kuan CJ, Zoval J, O'Rourke E, Ruvkun G, Madou M, J Sze 2007. MEC-4/MEC-10 DEG/ENaC kanali orqali uzatiladigan tortishish kuchi DAF-16/ ni modulyatsiya qiladi. C. elegansdagi FoxO faoliyati. Genetika. 177:835-45. PMCID: PMC2034647

95. Samuelson AV, Carr, CE, and G Ruvkun 2007. Umr davomiyligini oshiradigan gen faoliyati. C. elegans insulinga o'xshash signal mutantlari. Genlar va rivojlanish 21: 2976-94. PMCID: PMC2049198

96. Parry DH, Xu, J and G Ruvkun 2007. Butun genomli RNK ekrani. C. elegans miRNK yo'l genlari. Joriy biologiya 17: 2013-22. PMCID: PMC2211719

97. Isenbarger TA, M Finney, C Ríos-Velázquez, J Handelsman va G Ruvkun 2007. Miniprimer PCR, mikrobial dunyoni ko'rish uchun yangi ob'ektiv. Appl Environ Microbiol. 2008 yil 74 fevral (3): 840-9. PMCID: PMC2227730

98. Pirs ML, Weston MD, Fritzsch B, Gabel HW, Ruvkun G, Soukup GA 2008. MicroRNA-183 oilasining saqlanishi va siliyer neyrosensor organ ifodasi. Evol Dev. 10(1):106-13. PMCID: PMC2637451

99. Samuelson AV, RR Klimczak, D Tompson, CE Carr va G Ruvkun 2008. Identifikatsiya C. elegans kengaytirilgan RNKi sezgir shtammlari yordamida uzoq umr ko'rishni tartibga soluvchi genlar. Sovuq bahor Harb Symp Quant Biol. 200772:489-97. PMID: 18419309

100. Gabel HW va G. Ruvkun 2008. ERI-1 eksonukleazasi 5.8S rRNK va RNKni qayta ishlashda saqlanib qolgan ikki tomonlama rolga ega. Nat Struct Mol Biol. 15: 531-3. PMCID: PMC2910399

101. Patel DS, Fang LL, Svy DK, Ruvkun G, Li W 2008. HSD-1ning genetik identifikatsiyasi, lichinkalarning rivojlanishini boshqaradigan saqlanib qolgan steroidogen ferment. Caenorhabditis elegans. Rivojlanish. 135: 2239-49. PMID: 18495818

102. Simon DJ, Madison JM, Conery AL, Tompson-Peer KL, Soskis M, Ruvkun G, Kaplan JM, Kim JK 2008. The microRNK miR-1 nerv-mushak birikmalarida MEF-2 ga bog'liq retrograd signalni tartibga soladi. 133-uya: 903-15. PMCID: PMC2553566

103. Fischer SEJ, MD Butler, Q Pan va G Ruvkun 2008. Trans-splicing in C. elegans salbiy RNK regulyatori ERI-6/7 hosil qiladi. Tabiat 455: 491-6. PMCID: PMC2756026

104. Vang MC, E O'Rourke va G Ruvkun 2008. Yog 'almashinuvi germline ildiz hujayralari va uzoq umr ko'rishni bog'laydi. C. elegans. Fan 322: 957-60. PMCID: PMC2760269

105. Isenbarger TA, CE Carr, SS Jonson, M Finney, GM Church, W Gilbert, MT Zuber, and G Ruvkun 2008. Er va boshqa sayyoralarda hayotni aniqlash uchun eng saqlanib qolgan genom segmentlari, Hayotning kelib chiqishi va biosferalar evolyutsiyasi, 38(6):517-33. 14 oktyabr. PMID: 18853276

106. Soukas AA, EA Kane, CE Carr, JA Melo, and G Ruvkun 2009. Rictor/TORC2 yog 'almashinuvini, ovqatlanishni, o'sishini va umr ko'rish davomiyligini tartibga soladi. Caenorhabditis elegans. Genlar va rivojlanish 23: 496-511. PMCID: PMC2648650

107. Butcher RA, JR Ragains, G Ruvkun, J Clardy, HY Mak. 2009 ning biosintezi C. elegans dauer feromoni. Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari 106(6):1875-9. PMCID: PMC2631283

108. Curran SP, X Wu, C Riedel va G Ruvkun 2009. Uzoq umr ko'rishda soma-to-germline transformatsiyasi C. elegans mutantlar. Tabiat 459: 1079-84. PMCID: PMC2716045

109. O'Rourke EJ, Soukas AA, Carr CE, G Ruvkun 2009. C. elegans asosiy yog'lar lizosoma bilan bog'liq organellalardan farqli bo'lgan pufakchalarda saqlanadi. Hujayra Metab.10(5):430-5. PMCID: PMC2921818

110. Sebastiani P, Montano M, Puca A, Solovieff N, Kojima T, Vang MC, Melista E, Meltzer M, Fischer SE, Andersen S, Xartli SH, Sedgewick A, Arai Y, Bergman A, Barzilai N, Terri DF, Riva A, Anselmi CV, Malovini A, Kitamoto A, Sawabe M, Arai T, Gondo Y, Steinberg MH, Hirose N, Atzmon G, Ruvkun G, Baldwin CT, Perls TT 2009. Odamlarda haddan tashqari qarilik bilan bog'liq RNKni tahrirlovchi genlar va umr ko'rish muddati bilan C. elegans. PLoS One. 2009 yil 144-dekabr (12): e8210. PMCID: PMC2788130

111. Meli VS, Osuna B, Ruvkun G, Frand AR 2010. MLT-10 DUF644 oilasini va eritish siklida ishtirok etuvchi prolinga boy takrorlanuvchi oqsillarni belgilaydi. Caenorhabditis elegans. Mol Biol hujayra. May 1521(10):1648-61. PMCID: PMC2869372

112. Chjan C, TA Montgomery, HW Gabel, SE Fischer, CM Phillips, N Fahlgren, C Sullivan, JC Carrington va G Ruvkun 2011. mut-16 va boshqalar mutator-sinf genlari 22G va 26G siRNK yo'llarini modulyatsiya qiladi Caenorhabditis elegans. Proc. Natl. akad. Sci., Yanvar 25108 (4): 1201-8. Epub 18-yanvar. PMCID: PMC3029761

113. Vang MC, W Min, G Ruvkun, XS Xie 2011. SRS mikroskopi bilan yog'ni tartibga soluvchi genlar uchun RNAi skriningi. Tabiat usullari, 8 (2) fevral: 135-8. EPub 16-yanvar. PMCID: PMC3061290

114. Hayes GD, C Riedel va G Ruvkun 2011. The Caenorhabditis elegans SOMI-1 sink barmoq oqsili va SWI/SNF tomonidan rivojlanishni tartibga solishga yordam beradi mir-84 mikroRNK. Genes Dev. 125 (19): 2079-92 yil. PMCID: PMC3197206

115. Fischer SEJ, TA Montgomery, C Zhang, N Fahlgren, A Xwang, CM Sullivan, JC Carrington va G Ruvkun 2011. ERI-6/7 helikazi so'nggi genlarni ko'paytirishga qaratilgan siRNKni kuchaytirish yo'lining birinchi bosqichida ishlaydi. PLoS Genet. 7 (11) noyabr: e1002369. Epub 10-noyabr. PMCID: PMC3213143

116. Russel S, AR Frand va G Ruvkun 2011. C. elegans tomonidan eritiladi pqn-47. Rivojlanish biologiyasi 360: 297-309. PMCID: PMC3618673

117. Kimura KD, Riddle DL va G. Ruvkun 2011 yil C. elegans DAF-2 insulinga o'xshash retseptorlari asab tizimida ko'p miqdorda ifodalanadi va ovqatlanish holati bilan tartibga solinadi. Sovuq bahor Harb Symp Quant Biol. 76:113-20. Epub 28-noyabr. PMID: 22123849

118. Wu X, Z Shi, M Cui, M Han va G. Ruvkun 2012. Retinoblastoma yo'li xromatin komplekslari tomonidan somatik hujayralardagi germline RNK yo'llarining repressiyasi. PLoS Genet. Mar8(3):e1002542. Epub 2012 yil 8-mart. PMCID: PMC3297578

119. Shi Z va G. Ruvkun 2012. Mevalonat yo'li mikroRNK faolligini tartibga soladi. Caenorhabditis elegans. Proc Natl Acad Sci US A. Mar 20109 (12): 4568-73. Epub 6 mart. PMCID: PMC3311396

120. Montgomery TA, Rim, E, Zhang, C, Dowen RH, Phillips CM, Fischer, SEJ and G. Ruvkun 2012. PIWI bilan bog'liq siRNK va piRNKlar ayniqsa C. elegans HEN1 orfologi tovuq - 1. PLoS Genetika, 8 aprel (4): e1002616. Epub 19 aprel. PMCID: PMC3334881

121. Melo JA va G Ruvkun 2012. Konservatsiyalanganlarning inaktivatsiyasi C. elegans genlar patogen va ksenobiotiklar bilan bog'liq himoya funktsiyalarini bajaradi. 149-uyali: 452-66. PMCID: PMC3613046

123. Chjan C, TA Montgomeri, SE Fisher, SM Garsiya, CG Riedel, N Fahlgren, CM Sallivan, JC Carrington va G Ruvkun 2012. The Caenorhabditis elegans RDE-10/RDE-11 kompleksi ikkilamchi siRNK kuchaytirilishini rag'batlantirish orqali RNKni boshqaradi.. Hozirgi biologiya 22:881-90. Epub 26 aprel. PMCID: PMC3371361

124. Phillips CM, PC Breen, TA Montgomery and G Ruvkun 2012. MUT-16 RNKning suspenziyasi uchun zarur bo'lgan perinuklear mutator o'choqlarining shakllanishiga yordam beradi. C. elegans germline. Genlar va rivojlanish 26: 1433-44. Epub 19-iyun. PMCID: PMC3403012

125. Shore DE, CE Carr and G Ruvkun 2012. Sitoprotektiv yo'llarning induksiyasi ko'plab uzoq umr ko'rish yo'llari bilan ta'minlangan umrni uzaytirishning markaziy qismidir. PloS Genetika 8(7):e1002792. PMCID: PMC3400582

126. Wählby C, Kamentsky L, Liu ZH, Riklin-Raviv T, Conery AL, O'Rourke EJ, Sokolnicki KL, Visvikis O, Ljosa V, Irazoqui JE, Golland P, Ruvkun G, Ausubel FM, Carpenter AE 2012 yil. yuqori o'tkazuvchanlik uchun tasvirni tahlil qilish asboblar to'plami C. elegans tahlillar Nat Methods 9:714-6. doi: 10.1038/nmeth.1984. PMCID: PMC3433711

127. Tacutu R, Shore DE, Budovsky A, de Magalhães JP, Ruvkun G, Fraifeld VE, Curran SP. ning bashorati C. elegans Inson va qurtlarning uzoq umr ko'rish tarmoqlari tomonidan uzoq umr ko'rish genlari 2012. PLoS One 20127(10):e48282. doi: 10.1371/journal.pone.0048282. Epub 2012 yil 29 oktyabr. PMCID: PMC3483217

128. Carr CE, H Rowedder, C Vafadari, CS Lui, E Cascio, MT Zuber va G Ruvkun 2013. In-situ hayotni aniqlash uchun biologik reagentlarning radiatsiya qarshiligi. Astrobiologiya 13-yanvar (1): 68-78. doi: 10.1089/ast.2012.0869. PMID: 23330963

129. Tabach Y, A Billi, G Hayes, O Zuk, H Gabel, R Kamath, M Newman, K Yacoby, B Chapman, M Borowsky, J Kim, and G Ruvkun 2013. Filogenetik naqshlar yordamida kichik RNK yo'li genlarini aniqlash saqlanish va divergentsiya. Tabiat Yanvar 31493(7434):694-8. doi: 10.1038/nature11779. Epub 2012 yil 23 dekabr. PMCID: PMC3762460

130. Shi Z, T Montgomery, Y Qi and G Ruvkun 2013. Yuqori o'tkazuvchanlik sekvensiyasi nematodalarda miRNK, piRNK va siRNK yo'llarining g'ayrioddiy suyuqligini ochib beradi. Genom tadqiqoti Mar23(3):497-508. doi: 10.1101/gr.149112.112. Epub 2013 yil 30-yanvar. PMCID: PMC3589538

131. O'Rourke EA, P Kuballa, R Xavier, and G Ruvkun 2013. w-6 Ko'p to'yinmagan yog'li kislotalar avtofagiyaning faollashuvi orqali umrini uzaytiradi. Genlar va rivojlanish fevral 1527 (4): 429-40. doi: 10.1101/gad.205294.112. Epub 7 fevral. PMCID: PMC3589559

132. Riedel CG, G Lima, NV. Kirienko, T Heimbucher, JA West, A Dillin, J Asara, and G Ruvkun 2013. DAF-16 stressga chidamlilik va uzoq umr ko'rish uchun SWI/SNF xromatin remodelatoridan foydalanadi. Tabiat hujayra biologiyasi, 2013 yil 15 may (5): 491-501. doi: 10.1038/ncb2720. Epub 21 aprel. PMCID: PMC3748955

133. Kirienko NV, DR Kirienko, J Larkins-Ford, C Wählby, G Ruvkun, FM Ausubel 2013 Pseudomonas aeruginosa Caenorhabditis elegans temir gomeostazini buzadi, bu esa gipoksiya reaktsiyasini va o'limni keltirib chiqaradi.. Hujayra xosti va mikrob, 13 (4): 406-16. doi: 10.1016/j.chom.2013.03.003. PMCID: PMC3641844

134. O'Rourke EA va G Ruvkun 2013. MXL-3 va HLH-30 lipoliz va otofagiyani ozuqa moddalarining mavjudligi bilan transkripsiya bilan bog'laydi. Tabiat hujayra biologiyasi, 2013 yil 15 iyun (6): 668-76. doi: 10.1038/ncb2741. Epub 2013 yil 21 aprel. PMCID: PMC3723461

135. Carr CE, Rowedder H, Lui CS, Zlatkovsky I, Papalias CW, Bolander J, Myers JW, Bustillo J, Rothberg JM, Zuber MT, and G Ruvkun 2013. In situ hayotni aniqlash uchun ketma-ketlik chiplarining radiatsiya qarshiligi. Astrobiologiya. 2013 yil 4-iyun. PMID: 23734755

136. Shi Z, G Hayes va G Ruvkun 2013. Ikki tomonlama tartibga solish lin-14 tomonidan maqsadli mRNK lin-4 miRNK. PloS One, 138-sentabr(9):e75475. doi: 10.1371/journal.pone.0075475. PMCID: PMC3772890

137. Tabach Y, T Golan, A Hernández-Hernández AR Messer, T Fukuda, A Kouznetsova, JG Liu, I Lilienthal, C Levy va G Ruvkun 2013. Filogenetik profillash orqali inson kasalliklarining lokalizatsiyasini aniqlash va molekulyar yo'llarni xaritalash. Molekulyar tizimlar biologiyasi, 19 oktyabr: 692.doi: 10.1038/msb.2013.50. PMCID: PMC3817400

138. Soukas AA, CE Carr va G Ruvkun 2013. Genetik regulyatsiya C. elegans Lizosoma bilan bog'liq organellalar funktsiyasi. PloS Genetika, 9-oktabr (10): e1003908. doi: 10.1371/journal.pgen.1003908. Epub 24 oktyabr. PMCID: PMC3812091

139. Fischer SEJ, Q Pan, PC. Breen, Y Qi, Z Shi, C Zhang, TA Montgomery, and G Ruvkun 2013. Ko'p kichik RNK yo'llari takroriy va begona genlarning jim bo'lishini tartibga soladi. C. elegans. Genlar va rivojlanish, 2013 yil 1527-dekabr (24): 2678-95. doi: 10.1101/gad.233254.113, PMCID: PMC3877757

140. Schwartz S, Agarwala SD, Mumbach MR, Jovanovich M, Mertins P, Shishkin A, Tabach Y, Mikkelsen TS, Satija R, Ruvkun G, Carr SA, Lander ES, Fink GR, Regev A. 2013. Yuqori aniqlikdagi xaritalash xamirturush meiozida saqlangan, keng tarqalgan, dinamik mRNK metillash dasturini ochib beradi. Hujayra. 2013 yil 5155-dekabr (6): 1409-21. doi: 10.1016/j.cell.2013.10.047. Epub 2013 yil 21-noyabr. PMCID: PMC3956118

141. Liu Y, BS Samuel, PC Breen va G Ruvkun 2014 yil. Caenorhabditis elegans mitoxondriyalarni kuzatuvchi va himoya qiluvchi yo'llar. Tabiat. 2014 yil aprel 17508 (7496): 406-10. doi: 10.1038/nature13204. Epub 2014 yil 2 aprel. PMCID: PMC4102179

142. Phillips CM, Rim Y, Roovers, E, Breen PC, Ohsumi, TK, van Wolfswinkel, JC, Ketting, RF, Ruvkun, G, TA Montgomery 2014. MUT-14 va SMUT-1 DEAD qutisi RNK spirallari bir-biriga mos keladigan rollarga ega. germline RNKi va endogen siRNK shakllanishida. Curr Biol. 2014 yil aprel 1424 (8): 839-44. doi: 10.1016/j.cub.2014.02.060. Epub 2014 yil 27 mart. PMCID: PMC4010136

143. Garcia SMDA, Y Tabach, G Lourenço va G Ruvkun 2014. Trinukleotid-takroriy RNKning toksiklik yo'llarida genlarni aniqlash C. elegans. Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi, 2014 yil 21 avgust (8): 712-20. doi: 10.1038/nsmb.2858. Epub 2014 yil 20-iyul.PMID: 25038802.

144. Wang MC, HD Oakley, CE Carr, JN Sowa, G Ruvkun 2014. Kechiktiruvchi gen yo'llari Caenorhabditis elegans reproduktiv qarish. PLoS Genet. 2014 yil 410-dekabr (12): e1004752. doi: 10.1371/journal.pgen.1004752. eCollection 2014-yil dekabr PMID: 25474471

145. Kirienko NV, FM Ausubel va G Ruvkun 2015. Mitofagiya Pseudomonas aeruginosa tomonidan siderofor vositachiligida o'ldirishga qarshilik ko'rsatadi. Proc Natl Acad Sci US A., 2015 fevral 10112 (6): 1821-6. doi: 10.1073/pnas.1424954112. Epub 2015 yil 26 yanvar. PMID: 25624506

146. Sadreyev IR, Ji F, Cohen E, Ruvkun G, Tabach Y. 2015. Normallashtirilgan filogenetik profillar yordamida birgalikda rivojlanayotgan oqsillarni aniqlash va vizualizatsiya qilish uchun PhyloGene serveri. Nuklein kislotalari Res. 143 iyul (W1): W154-9. doi: 10.1093/nar/gkv452. Epub 2015 yil 9-may. PMID: 25958392

147. Phillips CM, Brown KC, Montgomery BE, Ruvkun G, Montgomery TA. 2015. piRNK va piRNKga bog'liq siRNKlar saqlanib qolgan va muhim himoya qiladi C. elegans genlarni RNK yo'liga noto'g'ri yo'naltirish. Dev xujayrasi. 2015 yil avgust 2434 (4): 457-65. doi: 10.1016/j.devcel.2015.07.009. Epub 2015 yil 13-avgust.PMID:26279487

148. Govindan JA, E Jayamani, X Zhang, P Breen, J Larkins-Ford, E Mylonakis va G Ruvkun. 2015. Lipid signalizatsiya juftliklar translyatsion kuzatuv yilda tizimli detoksifikatsiya Caenorhabditis elegans. Nat Cell Biol. 2015 yil 17 oktyabr (10): 1294-303. doi: 10.1038/ncb3229. Epub 2015 yil 31-avgust.PMID: 26322678

149. Govindan JA, Jayamani E, Chjan X, Mylonakis E va G Ruvkun. 2015. E. coli erkin radikal yo'llari va mitoxondriyalari o'rtasidagi dialog C. elegans. Proc Natl Acad Sci US A. 2015 yil 21-sentabr. pii: 201517448. PMID: 26392561

150. Rettberg P, Anesio AM, Baker VR, Baross JA, Cady SL, Detsis E, Foreman CM, Hauber E, Ori GG, Pearce DA, Renno NO, Ruvkun G, Sattler B, Saunders MP, Smit DH, Vagner D, Westall F. 2016. Sayyoralarni himoya qilish va Marsning maxsus hududlari - ta'rifni yangilash bo'yicha taklif. Astrobiologiya. 2016 yil 16 fevral (2): 119-25. doi: 10.1089/ast.2016.1472. PMID: 26848950.

151. Samuel BS, H Rowedder, C Braendle, MA Feliks, G Ruvkun. 2016 yil. Caenorhabditis elegans tabiiy yashash joylaridan bakteriyalarga javob. Proc Natl Acad Sci US A., 2016.. pii: 201607183. PMID: 27317746

152. Dowen RH, PC Breen, T Tullius, AL Conery va G Ruvkun. 2016. yilda mikroRNK dasturi C. elegans gipodermis ichakdagi mTORC2/PQM-1 signaliga bog'lanib, yog 'tashilishini modulyatsiya qiladi. Genes Dev. 2016 yil 130 iyul (13): 1515-28. doi: 10.1101/gad.283895.116. PMID: 27401555

153. Lehrbach NJ va G Ruvkun. 2016. Proteazoma disfunktsiyasi DDI-1 aspartik proteazasi tomonidan SKN-1A/Nrf1 ning faollashuvini keltirib chiqaradi. bioRxiv preprint onlayn chop etildi May. 12, 2016 yil doi: http://dx.doi.org/10.1101/052936. Elife. 2016 yil avgust 165. pii: e17721. doi: 10.7554/eLife.17721. PMID: 27528192

154. Mojarro A, Ruvkun G, Zuber MT, Carr CE. In situ hayotni aniqlash uchun sintetik Mars analog tuproqlaridan nuklein kislotasi ekstraktsiyasi. Astrobiologiya. 2017 yil 13 iyul. doi: 10.1089/ast.2016.1535. PMID: 28704064

155. Pontefract A, TF Zhu, VK Walker, H Hepburn, C Lui, MT Zuber, G Ruvkun va CE Carr. 2017. Gipersalin sulfat ko'lidagi mikrobial xilma-xillik: Qadimgi Marsning quruqlik analogi. Mikrobiologiyadagi chegaralar, Ekstremal mikrobiologiya bo'limi, Front Microbiol. 2017 yil 268-sentabr:1819. doi: 10.3389/fmicb.2017.01819. eCollection 2017. PMID: 29018418

156. Mojarro A, J Hachey, G Ruvkun, MT Zuber va CE Karr. 2018. CarrierSeq: past kirishli nanoporlarni sekvensiyalash uchun ketma-ketlikni tahlil qilish ish jarayoni. BMC Bioinformatika. 2018 yil mart 2719 (1): 108. doi: 10.1186/s12859-018-2124-3. PMID: 29587645

157. Newman MA, Ji F, Fischer SEJ, Anselmo A, Sadreyev RI, G Ruvkun. 2018. Pre-mRNK qo'shilishi kuzatuvi dastlabki qadamdir C. elegans Endogen genlarning RNKi. Genes Dev. 2018 yil 132-may (9-10): 670-681. doi: 10.1101/gad.311514.118. Epub 2018 yil 8-may. PMID: 29739806

158. Alexander JK, JR Casani, L Chiao, DP Fidler, J Gabrynowicz, GS Hubbard, EH Levy, N Noonan, K Olden, F Raulin, G Ruvkun, MP Saunders, BA Simmons, PD Stabekis, A Steele, DH Smith. 2018. Sayyoralarni himoya qilish siyosatini ishlab chiqish jarayonlarini ko'rib chiqish va baholash. Sayyoralarni himoya qilish siyosatini ishlab chiqish jarayonlarini ko'rib chiqish qo'mitasi, Kosmik tadqiqotlar kengashi. https://doi.org/10.17226/25172.

159. Karr Idoralar, NC Bryan, KN Saboda, SA Bhattaru, G Ruvkun, MT Zuber. 2018. Parabolik parvoz NPJ Microgravity uchun tezlashtirish profillari va ishlov berish usullari. 2018 yil avgust 74:14. doi: 10.1038/s41526-018-0050-3. eCollection 2018. PMID: 30109261

160. Pontefract A, Hachey J, Zuber MT, Ruvkun G, Carr CE 2018. Hech narsa ketma-ketligi: Nanoporalarni sezishning nosozlik usullarini va hayotni aniqlashga ta'sirini o'rganish. Life Sci Space Res (Amst). 2018 yil 18 avgust: 80-86. doi: 10.1016/j.lssr.2018.05.004. Epub 2018 yil 16-may. PMID: 30100151

161. Tillman EJ, Richardson CE, Ketti DJ, Reddy KC, Lehrbach NJ, Droste R, Ruvkun G, Kim DH. 2018. Endoplazmatik retikulum gomeostazi Caenorhabditis elegans infektsiyasi paytida FKH-9 transkripsiya faktori bilan modulyatsiya qilinadi. Genetika. 2018 yil 210 dekabr (4): 1329-1337. doi: 10.1534/genetika.118.301450. Epub 2018 yil 4 oktyabr. PMID: 30287474

162. Lin XX, Sen I, Janssens GE, Zhou X, Fonslow BR, Edgar D, Stroustrup N, Swoboda P, Yates JR 3rd, Ruvkun G, Riedel CG. DAF-16 / FOXO va HLH-30 / TFEB stressga chidamlilik va uzoq umr ko'rishni rag'batlantirish uchun kombinatsion transkripsiya omillari sifatida ishlaydi. Nat Commun. 2018 yil 239 oktyabr (1): 4400. doi: 10.1038/s41467-018-06624-0. PMID: 30353013

163. Kniazeva M va G Ruvkun. 2019. Rhizobium DNKning shikastlanishiga olib keladi Caenorhabditis elegans ichak hujayralari. Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari, Proc Natl Acad Sci U S A. 2019-yil fevral 26116(9):3784-3792. doi: 10.1073/pnas.1815656116. Epub 2019, 11-fevral. PMID: 30808764

164. Mao K, F Ji, PC Breen, A Sewell, M Xan, R Sadreyev va G Ruvkun. 2019. Mitoxondriyal disfunktsiya C. elegans mitoxondriyal relokalizatsiya va yadroviy gormon retseptorlariga bog'liq detoksifikatsiya genlarini faollashtiradi. Hujayra Metab. 2019 yil 14-fevral. pii: S1550-4131 (19) 30022-1. doi: 10.1016/j.cmet.2019.01.022. [Epub chop etishdan oldin] PMID: 30799287

165. Warnhoff K va G Ruvkun. 2019. Molibden kofaktorining bakteriyalardan nematodaga o‘tishi sulfitning detoksifikatsiyasiga vositachilik qiladi. Nat Chem Biol. 2019 yil 15-may (5):480-488. doi: 10.1038/s41589-019-0249-y. Epub 2019 yil 25 mart. PMID: 30911177

166. Lehrbach NJ va G Ruvkun. 2019. ER bilan bog‘langan SKN-1A/Nrf1 sitoplazmatik ochilgan oqsil reaksiyasiga vositachilik qiladi va uzoq umr ko‘rishga yordam beradi. Elife. 2019 yil 118-aprel. pii: e44425. doi: 10.7554/eLife.44425. PMID: 30973820

167. Lehrbach NJ, PC Breen va G Ruvkun. 2019. SKN-1A/Nrf1 ning oqsil ketma-ketligini peptid:N-glikanaza yordamida tahrirlash proteazoma gen ifodasini nazorat qiladi. Hujayra. 2019 yil aprel 18177(3):737-750.e15. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.035. PMID: 31002798

168. Ast T, Meisel JD, Patra S, Vang H, Grange RMH, Kim SH, Calvo SE, Orefice LL, Nagashima F, Ichinose F, Zapol WM, Ruvkun G, Barondeau DP, Mootha VK. 2019 gipoksiya temir oltingugurt klasteri biogenezini tiklash orqali frataksin yo'qolishini qutqaradi. Hujayra. 2019 yil 23 aprel. pii: S0092-8674 (19) 30346-0. doi: 10.1016/j.cell.2019.03.045. [Epub chop etishdan oldin] PMID: 31031004

169. Mojarro A, J Hachey, R Beyli, M Braun, R Doebler, G Ruvkun, MT Zuber va CE Carr. In situ hayotni aniqlash uchun past biomassali sintetik Mars analog tuproqlaridan nuklein kislotasini olish va ketma-ketlik. Astrobiologiya, 2019 yil 11 iyun. doi: 10.1089/ast.2018.1929. [Epub chop etishdan oldin] PMID: 31204862

170. Armakola M va G Ruvkun 2019. Regulyatsiya Caenorhabditis elegans heteroxronik genlar tomonidan neyronlarning qutblanishi. Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 yil 4-iyun. pii: 201820928. doi: 10.1073/pnas.1820928116. [Epub chop etishdan oldin] PMID: 31164416

171. Govindan, JA, E Jayamani va G Ruvkun. 2019. ROSga asoslangan o'limga olib kelishi C. elegans E. coli sideroforida yetishtirilgan mitoxondrial elektron transport mutantlari temir ajralib chiqadigan mutantlar Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 yil 7 oktyabr. pii: 201912628. doi: 10.1073/pnas.1912628116. [Epub chop etishdan oldin] PMID: 31591219

172. Fischer, SEJ va G Ruvkun. 2020. Caenorhabditis elegans ADAR tahrirlash va ERI-6/7/MOV10 RNAi yo‘li endogen virus elementlari va LTR retrotranspozonlarini o‘chiradi. Proc Natl Acad Sci US A. 2020 yil mart 17117 (11): 5987-5996. doi: 10.1073/pnas.1919028117. Epub 2020, 2-mart. PMID: 32123111

173. Wei W va Gary Ruvkun 2020. Lizosomal faollikni tartibga soladi Caenorhabditis elegans B12 vitamini metabolizmi orqali mitoxondrial dinamika bioRxiv 2020.04.20.049502 doi: https://doi.org/10.1101/2020.04.20.049502. Proc Natl Acad Sci US A. 2020 yil avgust 18117 (33): 19970-19981. doi: 10.1073/pnas.2008021117. Epub 2020, 31-iyul.PMID: 32737159

174. Carr, CE, NC Bryant, KN Saboda, SA Bhattaru, G Ruvkun MT Zuber 2020. Mars, Yevropa va mikrogravitatsiya sharoitida nanoporlarni ketma-ketlashtirish npj Mikrogravitatsiya 6: 24

175. Govindan, JA, E Jayamani, V Lelyveld, J Szostak va G Ruvkun. 2020. Bakterial karotinoidlar bostiradi Caenorhabditis elegans tarjima disfunktsiyasini kuzatish va himoya qilish. bioRxiv 2020.01.08.898668 doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.08.898668

176. Mao K, P Breen, G Ruvkun 2020. Mitoxondrial disfunktsiya sutemizuvchilarning RIG-I antiviral javobiga homolog bo'lgan yo'l orqali C. elegansda RNK aralashuvini keltirib chiqaradi. PLoS Biol. 2020-yil, 218(12)-dekabr:e3000996. doi: 10.1371/journal.pbio.3000996. Bosib chiqarishdan oldin onlayn.PMID: 33264285

177. Charlesworth, AG, NJ Lehrbach, U Seroussi, MS Renaud, RI Molnar, JR Woock, MJ Aber, AJ Diao, G Ruvkun, JM Claycomb. 2020. Muhimning ikkita izoformasi C. elegans Argonaute CSR-1 alohida kichik RNK sinflari orqali sperma va oositlar unumdorligini differentsial tartibga soladi. bioRxiv 2020.07.20.212050.

178. Warnhoff, K, TW. Hercher, RR Mendel, G Ruvkun Protein bilan bog'langan molibden kofaktori biologik mavjud bo'lib, molibden kofaktori etishmovchiligini qutqaradi. C. elegans, matbuotda Genlar va rivojlanish. bioRxiv 2020.10.08.332338 doi: https://doi.org/10.1101/2020.10.08.332338

Tadqiqotni qo'llab-quvvatlash

5 R01GM44619-27 NIH nazorati C. elegans geteroxronik genlar bo'yicha nasl-nasab. 05.01.1991 - 30.11.20. To'g'ridan-to'g'ri xarajatlar $379,000 $648,090 Yiliga jami xarajatlar, 30% harakat.

5 R01 AG16636-21 NIH Uzoq umr ko'rishning genetik va molekulyar asoslari. 01.04.1999 - 28.02.21. 20% harakat. $262,835 To'g'ridan-to'g'ri xarajatlar, $457,333 Umumiy xarajatlar.

5 R01 AG043184-23 C. elegans qarish va diapauzada NIH Inositol signalizatsiyasi. 20% harakat. 05.01.1996 - 31.03.2022 Byudjet davri: 09.01.2017 - 31.03.2018 Loyiha davri: 15.08.2012 - 31.03.2022 To'g'ridan-to'g'ri xarajatlar $276,999, jami $67.

Grace Science Foundation: PNG-1/NGLY1 tomonidan proteazomani tartibga solish Bosh tadqiqotchi: Gari Ruvkun Grantning umumiy miqdori: $100,000 Boshlanish sanasi: 2016-yil 14-oktabr Tugash sanasi: 2020-yil 31-dekabr

Fridreyxning ataksiya tezlatgichi temir oltingugurt klasterini yig'ish omili geni bo'yicha tadqiqotlarni qo'llab-quvvatlaydi. frh-1 tadqiqot.
TAKLIF RAQAMI: 2020A011058 09.01.2020 dan 14.07.2023 gacha

NASA NNH14ZDA001NMATISSE. Erdan tashqaridagi genomlarni qidirish (SETG): Marsdagi hayotning ajdodlaridan Yerdagi hayot bilan bog'liq bo'lgan in-situ detektori. PI: Mariya Zuber 5% harakat. Ruvkun ko-I, 5% harakat. Bo'lajak parvozga tayyorgarlik ko'rayotgan etuk SETG. Nuklein kislotalarning ekstraktsiyasi va tozalanishi, so'ngra DNKning bir molekulali nanopora ketma-ketligini ko'rsating. 1 yil 970 392,25 dollar 2015 yil 1 maydan 2015 yil 30 aprelgacha. 2 yil 958 467,88 dollar 2016 yil 1 maydan 2016 yil 30 aprelgacha, 3 yil 998 199,79 dollar 2017 yil 1 maydan 301 aprelgacha.

Ruvkun laboratoriyasiga doktorlikdan keyingi stipendiyalar:

1. Kurt Warnhoff, Deymon Runyon doktorlikdan keyingi stipendiya (6/21 gacha)

2. Josh Meisel, Jeyn Coffin Childs Postdoctoral Fellowship (8/21 gacha) va K99 boshlanadi.

2007 yil bahori Genetika 206 (Perrimon, Vidal bilan). 6 ta ma'ruza va suhbat.

Kuz va bahor 2007, 2008 Hayot fanlari 190, Kurs direktori, Schrag, Kolter, Cavanaugh bilan.

2004 yildan 2012 yilgacha Qarish biologiyasi yozgi kursi, Dengiz biologik laboratoriyasi, Woods Hole bo'yicha direktor.

2016 To'rt ma'ruza Astronomiya 305, Hayotning kelib chiqishi mavzusidagi mavzular tadqiqoti.

2017 yildan 2020 yilgacha taklif qilingan taqdimotlar

2017 Jet Propulsion Laboratory, Caltech

2017 yil Salk instituti RNK simpoziumi

Insulin signalizatsiyasi bo'yicha 2017 Gordon konferentsiyasi, Ventura

2017 Kaliforniya universiteti, Devis

2017 Kaliforniya universiteti, Santa Kruz

2017 Alabama universiteti, Birmingem

2017 Grace Foundation, Palo Alto

2017 Texas universiteti janubi-g'arbiy tibbiyot markazi

2017 Kaliforniya universiteti, San-Fransisko, biokimyo va biofizika

2017 Kanada ilg'or tadqiqotlar instituti, Toronto

2018 Sanford Burnham noyob genetik kasalliklar simpoziumi, San-Diego

2018 Jeyms Uotson tavalludining 90 yilligi Cold Spring Harbor

2018 RNK dastgohi, Massachusets universiteti

2018 Milliy saraton instituti taniqli ma'ruzalar seriyasi

2018 Bak instituti 30 yillik qarish tadqiqot simpoziumi

2018-yilgi yutuq muhokamasi, Galaktika boʻylab hayot migratsiyasi, Astrofizika markazi, Garvard

2019 Mars namunasi Qaytish sayyora himoyasi uchrashuvi, Jet Propulsion Laboratory, Pasadena Caltech

2019 yilgi yutuq muhokamasi, Galaktika boʻylab hayot migratsiyasi, Berkli

2019 Kanada ilg'or tadqiqotlar instituti Santa Kruz uchrashuvi

Yallig'lanish va metabolizm bo'yicha 2019 Keystone uchrashuvi, Vankuver BC

2019 Gordon Qarish bo'yicha tadqiqot konferentsiyasi, Yakshanba River Meyn

2019 Ketsen ma'ruzasi, Andrus Qarish Markazi, USC

2020 Toronto universiteti, Donnelli genom markazi

Patentlar berilgan

1. Berilgan 5/1/2001 AQSh patenti № 6,225,120 Glyukoza bardoshliligining buzilishi holatlari uchun terapevtik va diagnostika vositalari.

2. 10/8/2002 AQSH patenti № 6,461,854 Infektsiya yoki patogenlikning oldini olish uchun foydali bo'lgan aralashmalarni tekshirish usullari.

3. 8/19/2008 AQSH patenti № 7,414,169 Glyukoza bardoshliligining buzilishi holatlari uchun terapevtik va diagnostika vositalari

Patent uchun arizalar

WO-2020162959-A1

Ko'ngil aynishini davolash yoki oldini olish uchun karotenoidlar

AQSh-2019255124-A1

Mitoxondriyal funktsiyani yaxshilash uchun kompozitsiyalar va usullar

EP-3677909-A1

Detoksifikatsiya reaktsiyasini inhibe qilish usullari va tarkibi

AQSh-2019024080-A1

Detoksifikatsiya reaktsiyasini inhibe qilish usullari va tarkibi

AQSh-2017023551-A1

Oligonukleotidlarning takroriy RNK toksikligini nishonga olish vositalari va usullari

AQSh-2007087378-A1

Polinukleotid va polipeptid yog 'almashinuvi regulyatorlari va ulardan foydalanish

AQSh-2005260652-A1

RNK interferensiyasini modulyatsiya qiluvchi kompozitsiyalar va usullar

WO-2005074560-A3

RNA interferensiyasini kuchaytiruvchi kompozitsiyalar va usullar

WO-2004113501-A2

Lipidlarni to'plash bilan bog'liq usullar va kompozitsiyalar

WO-2004061087-A2

Ekdizozoan eritishni inhibe qilish usullari va kompozitsiyalari

AQSh-2003086871-A1

INFEKTSION yoki patogenlikning oldini olish uchun foydali bo'lgan aralashmalarni skrining usullari

AQSh-2003181364-A1

Glyukoza bardoshliligining buzilishi uchun terapevtik va diagnostika vositalari

AQSh-7414169-B2

Glyukoza bardoshliligining buzilishi uchun terapevtik va diagnostika vositalari

INFEKTSION yoki patogenlikning oldini olish uchun foydali bo'lgan aralashmalarni skrining usullari

HU-0002199-A2

Glyukoza bardoshliligining buzilishi uchun terapevtik va diagnostika vositalari

CA-2287839-A1

Glyukoza bardoshliligining buzilishi uchun terapevtik va diagnostika vositalari

INFEKTSION yoki patogenlikning oldini olish uchun foydali bo'lgan moddalarni tekshirish protseduralari

HU-0002781-A2

INFEKTSION yoki patogenlikning oldini olish uchun foydali bo'lgan aralashmalarni skrining usullari

AQSh-2001016332-A1

1 yoshdagi polipeptidlar va tegishli molekulalar va usullar

EP-0828520-A1

INFEKTSION yoki patogenlikning oldini olish uchun foydali bo'lgan aralashmalarni skrining usullari


Kirish

Saqlangan triglitseriddan erkin yog 'kislotalarining (FFA) mobilizatsiyasi asosiy hujayrali jarayon bo'lib, ko'plab to'qimalarda alfa-beta gidrolaza domenini o'z ichiga olgan 5 (ABHD5) ning yog' triglitserid lipazasi (ATGL) bilan funktsional o'zaro ta'siri orqali vositachilik qiladi. ABHD5 null mutatsiyalari lipolizni buzadi va ektopik lipidlar to'planishiga olib keladi. Arabidopsis 1 , C. elegans 2,3, sichqonlar 4,5 va odamlar (Chanarin-Dorfman sindromi 6). ABHD5 lipolizni boshqarishda hujayradan tashqari va hujayra ichidagi signallarni birlashtiradigan yog 'va mushaklarda ATGL faollashishi uchun juda muhimdir 7,8,9. Bundan tashqari, ABHD5 tomonidan lipaz faollashuvi yo'g'on ichak saratoni rivojlanishini bostiradi 10,11 va gepatit C virusi replikatsiyasini 12 rag'batlantiradi.

ATGL ning ABHD5 faollashuvining tarkibiy determinantlari yaxshi tushunilmagan. ABHD5 alfa-beta gidrolaza oilasining a'zosi bo'lsa-da, u konsensus katalitik triadaning serin nukleofiliga ega emas va shuning uchun gidrolitik faollikka ega emas 8 . Adipotsitlarda ABHD5 ning lipazni faollashtiruvchi funktsiyasi uning lipid tomchisi (LD) iskala bo'lgan perilipin 1 (PLIN1) bilan bog'lanishi bilan bostiriladi.Protein kinaz A (PKA) ni faollashtiradigan hujayradan tashqari signallar PLIN1 va ABHD5 ning fosforillanishiga olib keladi va ABHD5 ning chiqarilishini rag'batlantiradi, keyin esa ATGL 7,13,14 ni faollashtiradi. Bundan tashqari, ABHD5 endogen va sintetik ligandlarning to'g'ridan-to'g'ri maqsadi bo'lib, uning inhibitiv PLIN oqsillari 9 bilan o'zaro ta'sirini tartibga solish orqali lipazni faollashtiruvchi funktsiyasini modulyatsiya qiladi. ABHD5 ATGL 8,15 ni bog'laydi va PLIN oqsillari bu o'zaro ta'sirni 13,16,17,18 bilvosita tartibga solsa-da, ABHD5 tomonidan ATGL faollashuvining molekulyar asoslari noaniq bo'lib qolmoqda.

ATGL faollashuvi mexanizmi haqida tushunchaga ega bo'lish uchun biz ABHD5 bilan 50-55% ketma-ketlik o'xshashligini baham ko'radigan sutemizuvchilar va suyakli baliqlarda mavjud bo'lgan funktsional jihatdan ajralib turadigan ABHD5 va ABHD4 ning qiyosiy strukturaviy va evolyutsion tahlilini o'tkazdik. ABHD4 n-asil fosfatidilserin va n-asil fosfatidiletanolaminni gidrolizlaydi va ATGL faolligini rag'batlantirmaydi 19,20. Biz ABHD5 tomonidan ATGL faollashishi uchun zarur bo'lgan va ABHD4 (ABHD4 N303R/S332G) da ushbu faollikni ta'minlash uchun etarli bo'lgan ikkita yuqori darajada saqlanib qolgan ABHD5 aminokislotalarini (R299 va G328) aniqladik. Muhimi, lipolizda faol bo'lmagan ABHD5 mutantlarining tahlili ATGL faollashuvi ATGL translokatsiyasidan LD yuzasiga va ABHD5 ning PLIN oqsillari va sintetik ABHD5 ligandlari bilan o'zaro ta'siridan ajralib turishini ko'rsatdi. Shakl tahliliga asoslangan strukturaviy modellashtirish ABHD5-da yangi funktsional sirtni va ATGL faollashuvi uchun muhim bo'lgan qoldiqlarni o'z ichiga olgan ABHD4-funktsiyani oshirishni aniqladi.


Munozara

Fankoni anemiyasi bilan og'rigan odamlarning fenotipi shuni ko'rsatadiki, FA yo'li embrionning normal rivojlanishi, genomik barqarorlikni saqlash va ildiz hujayralarining bir nechta turlarini saqlab qolish uchun muhim ahamiyatga ega (Auerbach va boshq. 2001). Yaqinda ko'krak bezi saratoni geni kashf qilindi. BRCA2, FA geni (Howlett va boshq. 2002) bu noyob kasallikni saratonning keng tarqalgan shakli bilan bog'ladi. Shunga qaramay, FA/BRCA yo'lining aniq funksiya(lari) noma'lumligicha qolmoqda (D'Andrea va Grompe 2003). Biz va boshqalar avval sichqonlarning maqsadli o'chirilishi bilan sichqonlarning shtammlarini yaratdik Fanca, Fancc, va Fancg genlar, FA yadro kompleksining barcha komponentlari. Bu mutantlar juda o'xshash fenotiplarga ega (Chen va boshq. 1996 Whitney va boshq. 1996 Cheng va boshq. 2000 Yang va boshq. 2001 Koomen va boshq. 2002 Noll va boshq. 2002), kompleks tarkibiy qismlari ishtirok etadigan modelni qo'llab-quvvatlaydi. umumiy funktsiyada. Fancd2 faqat in vivo jonli ravishda ushbu funktsiyada ishtirok etadimi yoki qo'shimcha rollarga egami yoki yo'qligini aniqlash uchun biz ushbu genda null alleli bo'lgan sichqonlar shtammini yaratdik.

Ilgari olib borilgan tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, FANCD2 boshqa FA oqsillaridan ajralib turadigan noyob rollarga ega bo'lishi mumkin. Birinchidan, u FA yadroviy majmuasining quyi oqimida harakat qiladi va kompleks vositachiligida monoubikitatsiyaning maqsadi hisoblanadi (Garsia-Higuera va boshq. 2001 Timmers va boshq. 2001). Demak, FA yadro kompleksining yaxlitligi boshqa komplementatsiya guruhlaridan farqli o'laroq FA-D2 hujayralarida buzilmaydi (Garsia-Higuera va boshq. 1999 de Winter va boshq. 2000c). Ikkinchidan, FANCD2 DNK shikastlanishidan keyin yadro o'choqlarini hosil qiladigan va BRCA1 va RAD51 ta'mirlash oqsillari bilan birgalikda joylashishi uchun ma'lum bo'lgan yagona FA oqsilidir (Garcia-Higuera va boshq. 2001 Taniguchi va boshq. 2002a). Nihoyat, FANCD2 IR ga javoban ATM tomonidan to'g'ridan-to'g'ri fosforlanadi, lekin ICLlarga javob bermaydi (Nakanishi va boshq. 2002 Taniguchi va boshq. 2002b). Boshqa FA oqsillari ATM kinazining nishoni ekanligi ma'lum emas.

Ushbu biokimyoviy farqlarga qaramasdan, inson FA-D2 bemorlari boshqa komplementatsiya guruhlariga kiruvchi FA bemorlaridan klinik jihatdan sezilarli darajada farq qilmaydi (Timmers va boshq. 2001). Biroq, FA-D2 kamdan-kam uchraydigan komplementatsiya guruhidir va shu kungacha ma'lum qilingan barcha inson bemorlarida ba'zi qoldiq funktsiyaga ega bo'lishi mumkin bo'lgan kamida bitta mutant allel va shuning uchun haqiqiy fenotip mavjud. FANCD2- null mutatsiya noaniq bo'lib qoldi. The Fancd2 Bu yerda xabar qilingan mutant sichqonlar FA nokautli sichqonlarning ilgari xabar qilingan shtammlarining barcha xususiyatlarini aks ettiradi, lekin muhim farqlarga ham ega.

Fancd2, ionlashtiruvchi nurlanish va ATM signalizatsiya yo'li

Inson FANCD2 ning Ser 222 IR ga javoban ATM tomonidan fosforlanadi va bu posttranslatsiyaviy modifikatsiya abadiylashtirilgan fibroblastlarda IQ sezgirligini oshirish bilan bog'liq (Taniguchi va boshq. 2002b). Bundan tashqari, Ser 222 ning fosforillanishi radiatsiya ta'sirida DNK sintezining to'xtatilishi bilan bog'liq edi. Shuning uchun, Fancd2 IR ga javob berishda muhim rol o'ynaganmi yoki yo'qligini tekshirish uchun, izogenik, asosiy hujayralarning omon qolishi. Fancc mutant va Fancd2 mutant hujayralar solishtirildi. Qizig'i shundaki, Fancd2-null hujayralar bilan solishtirganda IR yoki ICLlarga nisbatan sezgir emas edi Fancc- null hujayralar. Bundan tashqari, in vivo jonli ravishda IQ ga engil yuqori sezuvchanlik kuzatilgan bo'lsa ham (LD50 = ~9,5 Gy), bu sezuvchanlik ham kuzatilganidan katta emas edi Fancc mutant sichqonlar (Noll va boshq. 2001).

Bundan tashqari, va undan farqli o'laroq ATM mutantlar, Fancd2-defisit hujayralar radiatsiyaga chidamli DNK sintezini ko'rsatmadi. Shuning uchun, sichqonchaning asosiy hujayralarida Fancd2 IR dan keyin ATM vositachiligidagi S-fazali tutilish uchun zarur emas. Umuman olganda, fenotipi Fancd2 mutant sichqonlar dan sezilarli darajada farq qiladi ATM- sezilarli radiatsiya sezgirligi, immunitet tanqisligi va gematologik o'smalarni ko'rsatadigan null sichqonlar (Xu va boshq. 1996). Birgalikda, bizning kuzatishlarimiz shuni ko'rsatadiki, Fancd2 IR ga ATM vositachiligidagi fiziologik javoblarda muhim rol o'ynamaydi. Ehtimol, inson FANCD2 va murin Fancd2 o'z funktsiyalarining shu jihati bilan farq qiladi, garchi oqsillar juda homolog bo'lsa va Ser 222 turlar orasida saqlanib qolgan. Shu bilan bir qatorda, Fancd2 faqat ba'zi o'ziga xos holatlarda, masalan, T-antigen o'lmas fibroblastlarda ATM funktsiyasining vositachisi rolini o'ynashi mumkin.

Yangi fenotiplar Fancd2 nokaut sichqonlari

Garchi Fancd2 mutant sichqonlar o'lchovli darajada farq qilmaydi Fancc Mutantlar DNK shikastlanishiga javob berish nuqtai nazaridan ularda ko'rilmagan ba'zi xususiyatlar mavjud Fanca, Fancc, yoki Fancg mutant hayvonlar. Ushbu fenotiplarga mikroftalmiya, perinatal o'lim, og'irroq gipogonadizm va o'sma rivojlanishi kiradi. FA yadro kompleksining normal funktsiyasi DNKning shikastlanishiga yoki DNK replikatsiyasiga javoban FANCD2 monoubiquitination uchun zarurdir (Garcia-Higuera va boshq. 2001 Taniguchi va boshq. 2002a). Shuning uchun mutantlar o'rtasidagi fenotiplarning farqini tushuntirish uchun ikkita asosiy model mavjud Fancd2 va yadro kompleksi genlari. Birinchidan, ubiquitinatsiyalanmagan Fancd2 oqsili mavjud Fanca, Fancc, va Fancg nokaut sichqonlari, FA yo'li uchun umumiy funktsiyada ba'zi qoldiq faollikka ega bo'lishi mumkin. Ushbu modelda yadro kompleksi genlarining nokautlari gipomorfik mutatsiyalarga o'xshash bo'ladi. Fancd2 gen. Fenotiplar bir xil biokimyoviy funktsiyaning etishmasligi natijasi bo'lar edi, ammo ular yanada jiddiyroq bo'ladi. Fancd2 mutant sichqonlar. Ikkinchi modelda FANCD2 ko'p funktsiyali oqsil bo'lib, u FA yo'lida va bog'liq bo'lmagan funktsiyalarda vositachilik qiluvchi boshqa domenlarda ishlaydigan domenga ega. ning qo'shimcha fenotiplari Fancd2 Keyinchalik mutantlar ushbu qo'shimcha funktsiyalarning etishmasligidan kelib chiqadi.

Ko'pgina xususiyatlarda kuzatiladi Fancd2-null sichqonchani boshqa FA nokautlarida ko'rilgan sifat jihatidan o'xshash nuqsonlarning yanada jiddiy namoyon bo'lishi sifatida talqin qilinishi mumkin. Bu jinsiy hujayra nuqsonlari bilan eng aniq ko'rinadi. Moyak og'irligi aniq ko'proq ta'sir ko'rsatadi-da Fancd2 mutant sichqonlar, gistologiya boshqa FA modellariga o'xshaydi. Xuddi shunday, biz ba'zilarning mutant avlodlarida mikroftalmiyani kuzatdik Fancc naslchilik juftlari (M. Grompe, unpubl.), bu haqiqatan ham yangi fenotip emasligini, balki barcha FA sichqonlari uchun umumiy bo'lgan nuqsonning to'liqroq namoyon bo'lishini ko'rsatadi. DNK shikastlanishidan keyin FA hujayralarining apoptotik hujayralar o'limiga yuqori sezuvchanligi kuzatilgan jinsiy hujayra etishmovchiligi, mikroftalmiya, kichik o'lcham va perinatal o'limga umumiy tushuntirish berishi mumkin. Ushbu rivojlanish nuqsonlari bo'lsa, hujayralar o'z-o'zidan DNK shikastlanishiga javob beradi. Umuman olganda, fenotipi Fancd2 mutant sichqonlar Fancd2 oqsilida qo'shimcha funktsional domenlar mavjudligini ishonchli tarzda aniqlamaydi.

Fancd2, Brca2 va karsinomalar

FA bo'lgan odamlarda turli xil saraton kasalliklari paydo bo'lishiga qaramasdan, boshqa FA nokautli sichqonlarda hatto juda kechki davrlarda ham o'smalar qayd etilmagan. Bundan farqli o'laroq, sichqonlarda kesish mutatsiyasiga ega ekanligi aniqlangan Brca2 turli xil neoplazmalarning rivojlanish xavfi yuqori (Connor va boshq. 1997 McAllister va boshq. 2002). Qizig'i shundaki, o'simta spektri Brca2 gipomorfik sichqonlar bilan solishtirish mumkin edi Fancd2 mutantlar (McAllister va boshq. 2002). Ikkala holatda ham epiteliya saratoniga moyillik kuzatildi va ularning paydo bo'lish yoshi bir xil edi. Brca2 gipomorfik sichqonlar, shuningdek, FAga o'xshash jinsiy hujayra nuqsoni, kichik o'lcham va perinatal o'lim kabi boshqa o'xshashliklarga ega. Birgalikda olganda, bu keng qamrovli fenotipik o'xshashlik Brca2 ning C-terminal domeni Fancd2 bilan bir xil yo'lda ishlaydi degan gipotezaga mos keladi.

Ma'lumki, inson BRCA2 gomologik rekombinatsiyaning markaziy o'yinchisi bo'lgan RAD51 faolligi bilan o'zaro ta'sir qiladi va uni modulyatsiya qiladi. Brca2 mutant hujayralar xatosiz rekombinatsiyada nuqsonlarga ega ekanligi ma'lum (Moynahan va boshq. 2001b Tutt va boshq. 2001). Shuning uchun identifikatsiya qilish Brca2 FA geni rekombinatsiya DNK ta'mirlashda FA yo'lining rolini qo'llab-quvvatlaydi. Bu gipoteza meyozning pakiten bosqichidagi xromosomalar bu yerda tasvirlanganidek noto'g'ri bo'lishini kuzatish bilan mustahkamlanadi. FA yo'lining potentsial funktsiyalaridan biri Rad51 va Brca2 o'rtasidagi o'zaro ta'sirni nazorat qilish va shu bilan DNKning shikastlanish joylarida homolog rekombinatsiya hodisalarini modulyatsiya qilish bo'lishi mumkin. Biroq, Western blot tahlili Fancd2 mutant to'qimalarda normal Rad51 darajalari, shuningdek, koimmunopresipitatsiya bilan aniqlangan Brca2 va Rad51 oqsillarining normal o'zaro ta'siri ko'rsatilgan. Bundan tashqari, DNK shikastlanishidan keyin Rad51 o'choqlarining shakllanishi normal edi Fancd2 –/– MEFlar. Shunday qilib, bizning ma'lumotlarimiz FA yo'li Brca2/Rad51 o'zaro ta'sirining barqarorligini/stavkasini boshqaradigan oddiy modelni qo'llab-quvvatlamaydi.

Odamlarda inaktivatsiya uchun heterozigotlik BRCA2 germ-line mutatsiyalari ko'krak, tuxumdon va oshqozon osti bezi saratoni, epiteliya kelib chiqishi barcha o'smalari bilan bog'liq. Nima uchun bu to'qimalar ayniqsa ta'sirlanganligi hozircha noma'lum, ammo kemiruvchilardagi epiteliya o'smalari telomerning qisqarishi bilan bog'liqligini ta'kidlash qiziq (Artandi va boshq. 2000 Chang va boshq. 2001). Inson FA bemorlari gematopoetik hujayralarda sezilarli darajada qisqartirilgan telomerlarni ko'rsatishi ma'lum (Leteurtre va boshq. 1999 Adelfalk va boshq. 2001 Brummendorf va boshq. 2001 Hanson va boshq. 2001) va shuning uchun FA / BRCA yo'lini taxmin qilish qiziq. ba'zi to'qimalarda telomerlarni saqlashda ishtirok etish.

Epiteliya o'smalarining yuqori chastotasi kuzatilgan Fancd2 mutantlar bu yerda ham masalani ko'taradi FANCD2 Ba'zi inson epitelial saratonlarida, ayniqsa ko'krak va tuxumdonlarda muhim gen bo'lishi mumkin. Muhimi, oilaviy tuxumdon saratonining ba'zi holatlari aynan qaysi mintaqa bilan bog'liq FANCD2 inson genomida joylashgan (Sekine va boshq. 2001 Simsir va boshq. 2001 Zhang va Xu 2002). FA genlarining sporadik yoki irsiy odam saratonida rol o'ynashini aniqlash uchun ushbu kasalliklarga chalingan odamlarning kelajakdagi tadqiqotlari kerak bo'ladi.


16.5: Mikro-hisobot 4- Komplementatsiya tahlili - Biologiya

1) Tavsif: Madaniy sutemizuvchilar hujayralarining genetik manipulyatsiyasi hujayra differentsiatsiyasi, genlarni tartibga solish, hujayra tuzilishi va funktsiyasi, shuningdek mutatsiya va rekombinatsiya kabi vijdonli genetik jarayonlar masalalariga zamonaviy eksperimental yondashuvdir. Hozirgacha eng keng tarqalgan bunday genetik manipulyatsiya sutemizuvchilar hujayralarini klonlangan genlar bilan transfeksiya qilishdir. Ushbu protseduraning kuchi sut emizuvchilarning ekilgan hujayralari bilan ishlaydigan deyarli har bir laboratoriyani sutemizuvchilar hujayralari genetikasi laboratoriyasiga aylantirdi va hech qanday kurs bunday tajribalarni birlashtirilgan tarzda hal qila olmadi. Ushbu kurs transfeksiya jarayonini, shuningdek, eng so'nggi ishlarga xos bo'lgan transfeksiyalarni o'z ichiga oladi. Shu bilan birga, yana uchta aniq genetik manipulyatsiyaga alohida e'tibor beriladi: (1) mutatsiya va mutantlarni izolyatsiya qilish va ekspluatatsiya qilish (2) hujayra sintezi va (3) gomologik rekombinatsiya natijasida hosil bo'lgan geterokarionlar va duragaylar yordamida genomlarni bir-biriga qo'shish. Ushbu manipulyatsiyalar ko'pincha o'z-o'zidan tekshirilayotgan jarayonlarni emas, balki genetik vositalarni ifodalaydi va ular ko'pincha shu ma'noda muhokama qilinadi. Natijada, o'qishlar ushbu yondashuvlarning mavzulari sifatida turli xil biologik savollarni o'z ichiga oladi. O'qishlar va ma'ruzalar ushbu yondashuvlarga kontseptual va tarixiy ma'lumot berish va ushbu turdagi joriy ishlardan namuna olish uchun mo'ljallangan. Vaqt imkon bersa, biz ushbu tadqiqotlarda qo'llaniladigan ba'zi molekulyar biologik usullarni ko'rib chiqamiz.

2) Format: Haftalik 2-2,5 soatlik uchrashuvlar (2-4 payshanba yoki 800-xonada 4:30) klassik va joriy adabiyotlarda ma'ruzalar va talabalar taqdimotlarini o'z ichiga oladi. Asosan ma'ruzalardan iborat bo'lgan dastlabki bir necha uchrashuvlardan so'ng haftalik o'qish muhokamasi bo'lib o'tadi. Talabalardan tasodifiy ravishda o'qishlardan biriga sharh berish yoki qisqacha xulosani taqdim etish so'raladi. Sharh batafsil savol, tanqid yoki xulosaning malakasi yoki ayniqsa qiziqarli yoki muhim bo'lgan topilma haqida bo'lishi mumkin. Bundan tashqari, batafsil ma'ruzaning oldindan tayyorlangan taqdimoti bo'ladi (pastga qarang). Munozara va talabalar taqdimotidan so'ng ma'ruza bo'ladi (

30 daqiqa) bu kelgusi haftaga tayinlangan o'qish uchun umumiy ko'rinishni/fonni taqdim etadi.

3) Talabalar taqdimotlari: Har bir talaba 1 dan 2 gacha javob beradi

semestr davomida o'ttiz daqiqalik maqola taqdimotlari. Yaxshi taqdimot qilish uchun fonni o'qish kerak bo'ladi. Talabalar o'qituvchi tomonidan ma'qullangan holda (oldindan) sessiya uchun sanab o'tilgan qog'oz o'rniga o'zlari tanlagan qog'ozga almashtirishlari mumkin. Talabalar ushbu taqdimotlar uchun jamoalarda ishlashlari mumkin, agar ular jamoa taqdimoti har bir jamoa a'zosi uchun taqdimotning yarmiga teng bo'lishini xohlasalar.

4) Imtihonlar va baholash: Oraliq nazorat topshirig'i sifatida qisqacha ma'ruza bo'ladi. Mavzu shu nuqtaga qadar o'tilgan mavzularga asoslangan eksperiment taklifidir. Taklif o'qilgan hujjatlarda tasvirlangan ishning kengaytmasi bo'lishi mumkin. Maqolalar elektron pochta orqali yuborilishi kerak va kursning veb-saytida keyinroq kurs davomida muhokama qilish uchun e'lon qilinadi. Yozma yakuniy imtihon bo'lib, bir soat ichida javob berishga mo'ljallangan. Baholar taqdimotlar (25%), oraliq nazorat (20%), yakuniy imtihon (25%) va o'qish bo'yicha mazmunli sharh/savol berish qobiliyatiga (30%, muvaffaqiyatli sharhlar nisbati asosida) asoslanadi. "hammasi yoki hech biri" asosi: har bir so'rov uchun 0 yoki 1. Oxirgi parametr, shubhasiz, o'z vaqtida o'qish va darsda qatnashish uchun mo'ljallangan.

5) Tayyorlanishi: Ushbu kurs biologiya bo'yicha magistratura talabalari uchun mo'ljallangan, lekin o'rta bakalavriat darajasida biokimyo, genetika va molekulyar biologiya bo'yicha bilimga ega bo'lgan va hujayra biologiyasi bilan biroz tanish bo'lgan bakalavr yoki aspirantlar uchun ochiq. Barcha o'qish ilmiy adabiyotlardan bo'ladi.

6) Ma'ruza va muhokama mavzulari jadvali (o'zgarishi mumkin)

Sessiya SanaMa'ruza mavzusi
1 1/20 Hujayra chiziqlari. Mutatsiya. Spontan mutatsiyalar tezligi. Diploidiya muammosi. Mutagenez.
2 1/27 Hujayra chiziqlari. Mutatsiya. Mutagenez. Diploidiya muammosi. Talaba taqdimoti yo'q. Mutantlarni tanlash. Ekspluatatsiya qilinadigan metabolik yo'llar. Dori vositalariga qarshilik. FACS. Antikorlar.
3 2/3 Mutantlar tanlash. Hujayra sintezi. Geterokarionlar.
4 2/10 Hujayra sintezi. Geterokarionlar. Gibrid hujayralar: komplementatsiya. Dominantlik/retsessivlik. Differensial fenotiplarning yo'q bo'lib ketishi
5 2/17 Gibrid hujayralar: tabaqalashtirilgan fenotiplarning yo'q bo'lib ketishi Transfeksiya. Birgalikda transfeksiya. Transfektsion genlarni klonlash.
6 2/24 Transfeksiya. Transfektsion genlarni klonlash. Rekombinatsiya. Genni nishonga olish, nokaut, almashtirish. Gen pozitsiyasining ta'siri. Gen chegarasi elementlari.
7 3/2 Genni nishonga olish. Gen nokauti. Genni almashtirish. Gen pozitsiyasining ta'siri. Genetik beqarorlik. Saraton hujayralari genetikasi. O'smalarni bostiruvchi genlar. Genetik beqarorlik.
8 3/9 Saraton hujayralari genetikasi. O'smalarni bostiruvchi genlar. Genetik beqarorlik. Genni kuchaytirish. Transfektsiyalangan genlarning birgalikda amplifikatsiyasi. Topshiriq yo'q, ammo keyingi yig'ilishda oraliq nazorat topshirilishi kerak.
3/16 Bahorgi ta'til Bahorgi ta'til
9 3/23 Usullarni muhokama qilish va kuzatish. Ko'proq genetik beqarorlik. Mutantlar hujayralar: signal uzatish mutantlari, xolesterin almashinuvi mutantlari, mRNKdan oldingi birlashuvchi mutantlar.
10 3/30 Mutantlar hujayralari Transfeksiya orqali gen identifikatsiyasi: mushak hujayralari differentsiatsiyasining triggerlari - (1) MyoD (2) 3' UTRs
11 4/6 Transfeksiya orqali gen identifikatsiyasi: mushaklarning differentsiatsiyasining triggerlari - (1) MyoD (2) 3' UTR Transfektsiya vositasida fenotipik blokirovka
12 4/13 Transfektsiya vositasida fenotipik blokirovka SELEX yordamida mutant molekulalarni izolyatsiya qilish.
13 4/20 SELEX yordamida mutant molekulalarni izolyatsiya qilish. DNKni aralashtirish. Mikromassivlar orqali mutant xarakteristikasi?
14 4/27 DNKni aralashtirish. Mikromassivlar orqali mutant xarakteristikasi?

Biol. G4054y 1-hafta, 2000-yil 20-yanvar 1-sessiya

Sutemizuvchilarning hujayra chiziqlari
Diploidiya va geteroploidiya muammosi
Spontan mutatsiyalar tezligini o'lchash. Tezlik va chastota. Dalgalanish tahlili.
Mutagenez. Kimyoviy va fizikaviy moddalar. Dozalash. Ifoda qilish davri. Metabolik hamkorlik.
Dominant va retsessiv mutatsiyalar
Mutagen o'ziga xosligi. Mutatsion spektrlar. Ipning o'ziga xosligi.

Keyingi safar muhokama qilinadigan o'qish:

1. Ko'pchilik lokuslar CHO hujayralarida ham diploiddir
Siciliano, M.J., J. Siciliano va R.M. Xamfri. 1978. Xitoy hamster tuxumdon hujayralarida elektroforetik siljish mutantlari: genetik diploidiya uchun dalillar. Proc. Natl.Akad.Sci. AQSh 75: 1919-1923.

2. Ikki DNK zanjiri mutagenezga turlicha sezgir
Carothers, A.M., J. Mucha va D. Grunberger. 1991. Dihidrofolat reduktaza genidagi (")-3?,4?-dihidroksi-1?,2?-epoksi-1,2,3,4-tetrahidrobenzo[c]fenantren tomonidan qo'zg'atilgan DNK zanjiriga xos mutatsiyalar. Proc. Natl.Akad.Sci.AQSh 88: 5749-5753

3. Mutatsiyalar tasodifiy sodir bo'ladi va mutatsiyaning spontan tezligini qanday o'lchash mumkin.
Luriya, S.E. va M. Delbrück. 1943. Bakteriyalarning virusga sezgirligidan virusga chidamliligiga mutatsiyalar. Genetika 8: 491-511. "Bakterial genetika bo'yicha maqolalar" da qayta nashr etilgan, E. Adelberg, ed. Kichkina Braun, Boston, 1960 yil.3-24-betlar. Shu bilan bir qatorda G. Stent, "Molekulyar genetika", Freeman, San-Fransisko, 1971, 148-157-betlardagi qisqaroq tavsifga qarang. Mutatsiyaning tasodifiy tabiatini ko'rsatadigan genetikada chinakam klassik qog'oz bo'lishidan tashqari, bu maqola fluktuatsiya tahlilidan spontan mutatsiya tezligini o'lchash vositasi sifatida foydalanishni tasvirlaydi, buni amalga oshirish oson emas. Bu erda nima qilinayotganini ko'rish uchun barcha matematikaga rioya qilish shart emas, shuning uchun uni baribir o'qing.

4. Madaniy hujayra liniyalarini abadiylashtirishning biokimyoviy asoslari.
A. G. Bodnar, M. Ouellette, M. Frolkis, S. E. Xolt, C. Chiu, G. B. Morin, C. B. Harley, J. W. Shay, S. Lichtshtayner, W. E. 1998 yil 16 yanvar. Fan 279: 349-352. Oddiy inson hujayralariga telomerazni kiritish orqali umrini uzaytirish. http://www.sciencemag.org/feature/data/telomerase/telomerase.shl

Stabil bo'lmagan allellar
Adair, G.M., R.S. Nairn, K.A. Brotherman va M.J.Siciliano. 1989. Spontan CHO APRT heterozigotlari yuqori chastotali, allelga xos, xromosoma Z4 APRT genini o'chirishni aks ettiradi. Somat. Hujayra Molec. Genet. 15: 535-544

Xromosoma yo'qolishi orqali heterozigotlikni yo'qotish
Li-C-Y. Yandell-D-W. Kichkina-J-B. 1992 yil. In vitroda inson hujayralarida heterozigotlikning spontan va induktsiyali yo'qolishining molekulyar mexanizmlari. Somat-hujayra-mol-genet. 18: 77-87.

Bir nechta mutatsiyalar mustaqil ravishda yuzaga kelmasligi mumkin
Li-C-Y. Yandell-D-W. Kichkina-J-B. 1992. Timidin kinaz genini funktsional yo'qotish uchun tanlangan inson limfoblast klonlarida tasodifiy mutatsiyalar uchun dalillar. Mol. Kanserogenez. 5: 270-7. (P&S kutubxonasida)

Mutagen bilan davolash qilingan hujayralarning kichik populyatsiyasi ko'p avlodlar uchun yuqori chastotada mutatsiyani davom ettiradi
Little JB, Nagasawa H, Pfenning T, Vetrovs H. Radiat Res 1997 Oct148 (4): 299-307. Radiatsiyadan kelib chiqqan genomik beqarorlik: rentgen nurlari va alfa zarralarining kechiktirilgan mutagen va sitogenetik ta'siri.

Retsessiv mutantlarni ajratish uchun ploid muammosini hal qilish: qo'sh mutantlarni qo'pol kuch tanlash
Chasin, L.A., 1974. Xitoy hamster hujayralarida adenin fosforiboziltransferaza faolligiga ta'sir qiluvchi mutatsiyalar. 2-uya: 37-41

Ploidiya hujayra zichligi va ekspressiya vaqtining retsessiv mutantlarni ajratish uchun muammo bo'lishi mumkin.
Chasin, L.A., 1973. Madaniy Xitoy hamster hujayralarida ploidiyaning kimyoviy mutagenezga ta'siri. J. Hujayra. Fiziol. 82: 299-308

Sutemizuvchilar hujayralarida qanday DNK o'zgarishlari o'z-o'zidan sodir bo'ladi?
Chjan, L-H., H. Vrieling, A. A. van Zeeland va D. Jenssen. 1992. V79 Xitoy hamster hujayralarining hprt genida o'z-o'zidan paydo bo'ladigan mutatsiyalar spektri. J. Mol. Biol. 223:627-635.

Mitoxondriyal genomda ta'sirlangan mutantlar ham tanlanishi mumkin.
Xofxaus, G. va G. Attardi. 1995. NADH dehidrogenazaning mitoxondrial DNK bilan kodlangan subbirliklarida nuqsonli bo'lgan inson hujayra chiziqlarini samarali tanlash va tavsiflash. Mol. Hujayra. Biol. 15:964-974 (tuzatish 15:3461)

G4054y 2-hafta, 2000-yil 27-yanvar 2-sessiya

Ma’ruza: Mutantlar tanlanishi

Ekspluatatsiya qilinadigan metabolik yo'llar: purin va pirimidin biosintezi. Aminokislotalar biosintezi.
Giyohvand moddalarga chidamliligi: 6-tioguanin (TG), 5-bromodeoksinridin (BrdU, BUdR), ouabain
FACS (Fluoresans bilan faollashtirilgan hujayralarni saralash)
Antikorlar. Komplement bilan lizis. Oksotroflar. Haroratga sezgir mutantlar: tritiy o'z joniga qasd qilish.
Sib tanlash, replika qoplamasi
Qaytaruvchilarni tanlash
Ifoda qilish davri
Hujayra zichligi ta'siri: o'zaro ovqatlanish, metabolik hamkorlik.

Keyingi safar muhokama qilinadigan o'qish:

1. BrdU o'z joniga qasd qilish orqali auksotroflar
Kao FT, Puck TT. Proc Natl Acad Sci U S A 1968 60: 1275-81. Sutemizuvchilarning somatik hujayralari genetikasi, VII. Xitoy hamster hujayralarida ozuqaviy mutantlarning induksiyasi va izolyatsiyasi.

2.Mutatsiyani ko'rsatuvchi dog 'mutantni o'ldiradi, uni "sib tanlovi" bilan ajratib olish mumkin
Rosenstraus M, Chasin LA. Proc Natl Acad Sci U S A 1975 72: 493-7. Glyukoza-6-fosfat dehidrogenaza faolligida etishmayotgan sutemizuvchilar hujayralari mutantlarining izolyatsiyasi: hipoksantin fosforiboziltransferaza bilan bog'lanish.

3. Sekretsiyalangan mahsulotni aniqlash orqali mutantlarni aniqlash (ajralmasligi).
Coffino P, Sharff MD. Proc Natl Acad Sci U S A 1971 J 68: 219-23 Sichqoncha miyelom hujayralari tomonidan immunoglobulin ishlab chiqarishda somatik mutatsiya tezligi.

4. Bir nechta zamonaviy texnikalar bo'yicha sayohat (ko'plari hali qamrab olinmagan, lekin qo'lingizdan kelganini qiling).
Rays GC, Goeddel DV, Cachianes G, Woronicz J, Chen EY, Williams SR, Leung DW. Proc Natl Acad Sci U S A 1992 89: 5467-71. Sutemizuvchilar hujayralarida to'g'ridan-to'g'ri ekspressiya qilish orqali ajratilgan oqsillarni tasodifiy PCR mutagenez skriningi.

Dori-darmonlarga chidamlilik, dozani nozik manipulyatsiya qilish bilan
Jons, GE va Sargent, PA. 1974. 2-uya: 43-54. Adenin fosforiboziltransferaza etishmovchiligi bo'lgan madaniyatli xitoy hamster hujayralarining mutantlari.

Fenotip o'rniga genotip uchun tanlash.
Khrapko K, Coller H, Andre P, Li XC, Foret F, Belenky A, Karger BL, Thilly WG Nuklein kislotalari Res 1997 25: 685-693 Fenotipik tanlovsiz mutatsion spektrometriya: inson mitoxondriyal DNKsi.

Sutemizuvchilar hujayralarining replika qoplamasi.
Stamato TD, Jones C Somatik hujayra Genet 1977 3: 639-47. Laktik dehidrogenaza-A-efitsit CHO-K1 mutantining neylon mato replika qoplamasi bilan izolyatsiyasi.

Koloniya skriningni o'z ichiga olgan mutant tanlovi
Nagan N, Hajra AK, Das AK, Moser HW, Moser A, Lazarow P, Purdue PE, Zoeller RA Proc Natl Acad Sci USA 1997 yil 2994 yil aprel (9): 4475-4480 Alkil-dihidroksiatsetonazada nuqsonli fibroblast hujayra liniyasi. Plazmalogen biosintezidagi yangi nuqson.

Giyohvand moddalarga chidamlilikni tanlash
Nohturfft A, Hua X, Brown MS, Goldstein JL Proc Natl Acad Sci USA 1996 Nov 2693 (24): 13709-13714. SREBP parchalanishini faollashtiruvchi oqsilning bitta kodonida takroriy G-A-ni almashtirish Xitoy hamsterining uchta mutant tuxumdon hujayralarida sterol qarshiligini keltirib chiqaradi.

Biol. G4054y 3-hafta, 2000-yil 3-fevral 3-sessiya

3-ma’ruza: Hujayra sintezi – Geterokarionlar.

Fusogen agentlar: PEG, Sendai virusi (sinsitiyani rag'batlantirish, OIV kabi).
Geterokarionlar. Gibridlar.
Sitoplastlar (sitokalazinli hujayralar), karyoplastlar, rekonstruksiya qilingan hujayralar, mitoxondriyal meros [CAP R, valinomisin R])
Mikro hujayralar (kolsemid tomonidan qo'zg'atilgan mikronukleuslar + sitokalazin orqali) va termoyadroviy. Xarita uchun pastga qarang)

Edidin: plazma membranasi oqsillarining harakatchanligi

Komplementatsiya (masalan, X. pigmentosum rejadan tashqari DNK sin. [taʼmirlash])

Genlarni tartibga solish bo'yicha tadqiqotlar: Hujayra siklini nazorat qilish (Rao va Jonson):

G2 x S = S ning pulverizatsiyasi, G2 --> kechiktirilgan M G2 nukda DNK sin yo'q.
G1 x S = S ikkalasida ham. G1 xromosomalari DNK sintezi uchun yaxshi substratdir (kutish shart emas)
G1 x G2 = G1 --> normal S, G2 --> kechiktirilgan M, G2 G1 ning DNK sintezini inhibe qilmaydi.

Piknotik yadrolarning qayta faollashishi (Genri Xarris, tovuq eritrotsitlari x HeLa)
RBC=arzimas sitoplazma yadrosi Hu yadrosini shishiradi. Ag yadrolari kattalashadi, sin RNK jo'ja mahsulotlari = sirt Ag HPRT DNK sintezi (H. Xarris)

OIV virusi sintezi simulyatsiyasi: CD4+ sichqoncha xujayrasi + GP120/GP41+ CHO xujayrasi. Terapevtik reagentlarni sinab ko'ring (masalan, sCD4 raqobatdosh oqsillari)

Ixtisoslashgan genlarni faollashtirish (mushak bo'lmagan hujayralardagi mushak genlari - oldindan ko'rish) (keyingi safar muhokama qilinadi)

Biokimyoviy tahlil uchun vaqtincha sintez (FB x GH3 -> PRL-CAT fibroblastlarda) (keyingi safar muhokama qilinadi)

Keyingi safar muhokama qilinadigan o'qish: 1. Geterokarionlarda maxsus genlarni yoqish
Blau, H., C.-P. Chiu va C. Webster. 1983. Barqaror geterokarionlarda inson yadro genlarining sitoplazmatik faollashuvi. 32-uya: 1171-1180.

2. Geterokarionlardan foydalanib, ba'zi hnRNP larning yadrodan tashqariga chiqib, keyin yana qaytib ketishini isbotlash
Pinol-Roma S va G. Dreyfuss. 1992. Yadro va sitoplazma o'rtasida mRNKdan oldingi bog'lovchi oqsillarni o'tkazish. Tabiat 355:730-2

3. Gipofiz hujayralarida ixtisoslashgan gen faollashtiruvchilarining mavjudligini ko'rsatish uchun vaqtinchalik sintez tajribasi
Lufkin, T. va Bancroft, C. 1987. Ijobiy trans-ta'sir etuvchi omillar bilan o'zaro ta'sir qiluvchi gen ketma-ketligini hujayra sintezi orqali aniqlash. Science 237: 283-286 Qo'shimcha takliflar:

DNK tuzatish mutantlari o'rtasida komplementatsiya tahlilini o'tkazish uchun heterokarionlardan foydalanish
Kraemer va boshqalar. 1975. Xeroderma pigmentosumdagi genetik heterojenlik: komplementatsiya guruhlari va ularning DNK ta'mirlash tezligiga aloqasi. P.N.A.S. 72: 59-63

Hujayra tsiklining turli bosqichlarida hujayralar o'rtasida hosil bo'lgan geterokarionlarda hujayra siklini boshqarish
Rao, P. va R.T. Jonson 1970. Sutemizuvchilar hujayralarining birlashishi: I. DNK sintezi va mitozni tartibga solish bo'yicha tadqiqotlar. Tabiat 225: 159-164

Geterokarionlarda boshqa sitoplazmaga ta'sir qilish orqali harakatsiz genlarning transaktivatsiyasi
Xarris, H. 1965. Turli xil hayvonlar hujayralarining geterokarionlarida differentsiatsiyalangan yadrolarning harakati. Tabiat 206: 583-588.

Hujayra membranasining suyuqligi geterokarionlarning hujayra sintezi natijasida hosil bo'lishi bilan namoyon bo'ladi.
Frye, L.D. va M. Edidin. 1970. Sichqoncha-inson geterokarionlari hosil bo'lgandan keyin hujayra yuzasi antijenlarining tez aralashishi.

Hujayra differentsiatsiyasining determinantlarini tekshirish uchun geterokarionlardan eng keng foydalanish
Blau, H. 1985. Uning myoblast heterokarionlari bo'yicha ishini ko'rib chiqish. Fan 230: 758

Mushaklarga xos ijobiy tartibga soluvchi omillar mavjudligini aniqlash uchun heterokarionlardan foydalanish
Miller, S.C., G.K. Pavlat, B.T. Bleykli va H.M. Blau. 1988. Mushak hujayralari komponentlari gepatotsitlar geni ifodasini va Golji apparatining geterokarionlarda tarqalishini belgilaydi. Genlar va Dev. 2: 330-340.

Hujayra sintezidan so'ng tezda yo'q bo'lib ketish boshlanadi
Junker S, Lamm M, Nielsen V, Matthias P. J Cell Sci, 1997 yil 110 oktyabr (Pt 20): 2579-2587 HeLa hujayralari bilan birlashganda B hujayralarida immunoglobulin gen ekspresyonining yo'q bo'lib ketishidan oldin muhim transkripsiya omillarining yadroviy kamayishi sodir bo'ladi. B hujayrasiga xos tarzda ifodalangan genlarning keng tarqalgan inaktivatsiyasi bilan birga.

(Biol G4054 o'qish ro'yxati 2: 4 va 5 haftalar: 2000 yil 10 va 17 fevral)

Biol. G4054y 4-hafta: 2000 yil 10-fevral

Ma'ruza: Hujayra sintezi - hujayra duragaylari
Haqiqiy gibrid hujayralarni tanlash (yadro sintezi)
Uchun: xaritalash to'ldiruvchi tahlil dom./ta'til. va tabaqalashtirilgan gen nazorati.
HAT tanlash (TK - x HPRT - ) Universal gibridizator (masalan, oua R HPRT - x WT) ekzog. genlar: neoR = G418R
Chastotalar: heterokaryonlar = 10%, duragaylar = 0,1% (hujayra sikli? sinxronizatsiya yordam beradi)
Belgilarsiz tanlash (zaharlar: ritsin x chuqurlik. toksin yodoasetamid x DEPC?)
Kibridlar hujayralarni qayta tikladilar
Dominantlik va resessivlikni baholash (masalan, MTX R : o'tkazuvchanlik = chuqurlik, boshqalar = dom : masalan, aqlli fermentlar, kuchaytirilgan lokuslar).
Komplementatsiya testlari (gly [4] , ade [-9] auksotrofiya)
Genetik xaritalash
Intraspesifik duragaylar va xromosomalarning tez ajralishi
Muvofiq segregatsiya. Quyidagi yo'llar bilan kuzatib boring: xromosoma tasmasi, xromosomalarni bo'yash, izozimlar, PCR.
Sichqoncha-inson va hamster-inson doimiy panellari (turli xil inson kombinatsiyalari).
(5 gibrid barcha sinteniyani ayta oladi: 5 bit=32: 1-6 1-8,17-24 1-4,9-12,17-20 12, 56 va hokazo toq)
Yagona inson xromosoma panellari mikrohujayra sintezi
Sub-xromosomali xaritalash: radiatsiya gibridlarining tabiiy translokatsiyasi (keyingi safar o'qishda)
To'qimalarga xos genlarning yo'q bo'lib ketishi yoki faollashishi:
melanomalar va pigmentatsiya (Efrussi, Devidson)
gepatomlar: albumin, jigar fermentlari (Vays). Mustaqillik (ajratish orqali) va dasturiy (ajratilgan variantlar)
gen (yadro) dozasi va faollashuvi (Darlington)
o'zaro yo'q bo'lib ketish (melanoma X gepatomasi) (Vays)
yo'q bo'lib ketish = gen repressiyasi, faollashtiruvchi repressiya, aktivatorni suyultirish ??
De novo metilatsiya
Karin misoli: gipofiz x FB = prolaktin: yo'q bo'lib ketish pit-1 aktivatorining etishmasligi bilan bog'liq (o'qishda):
O't o'chiruvchilarni xaritalash (Fournier [2 qog'oz])
Yo'q bo'lib ketish maqsadini aniqlash: Ekxardning hujjati keyingi safar muhokama qilinadi

Hujayra gibridlanishi: yo'q bo'lib ketish mexanizmlari

Keyingi safar muhokama qilinadigan o'qish:
1. Hujayra duragaylari qanday tanlanadi
Littlefield, J. 1964. In vitro va ularning taxmin qilingan rekombinantlari fibroblastlarning juftlashuvidan duragaylarni tanlash. Fan 145: 709-710.

2. Hujayra gibridizatsiyasi yordamida xromosoma ichidagi genlarni xaritalash misoli
Gyapay G, Shmitt K, Fizames C, Jons X, Vega-Kzarni N, Spillett D, Muselet
D, Prud'Homme JF, Dib C, Auffray C, Morissette J, Vayssenbax J, Gudfello
PN (1996) Inson genomining radiatsion gibrid xaritasi. Hum Mol Genet 1996 yil 5-mart (3): 339-46

3. Extinction transkripsiya omili ifodasini tartibga solishni o'z ichiga olishi mumkin.
Makkormik, A., D. Vu, J.L.Kastrillo, S. Dana, J. Strobl, E.B. Tompson va M. Karin. 1988. Somatik hujayra duragaylarida o'sish gormoni ekspressiyasining yo'qolishi o'ziga xos trans-aktivator GHF-1 repressiyasini o'z ichiga oladi.

4. Klassik kuchaytiruvchi elementlarga ta'sir qiluvchi yo'q bo'lishini ko'rsatish uchun tanlanadigan transgenlardan foydalanish,
Yu, H., Porton, B., Shen, L.Y. va Eckhardt, L.A. 1989. Immunoglobulin genini ifodalashning gibrid hujayra yo'qolishida oktamer motivining roli: yo'q bo'lib ketish ikkita kuchaytiruvchi tizimda ustunlik qiladi. Hujayra. 58: 441-8l 55: 379-389. Qo'shimcha takliflar:

Radiatsion duragaylar yordamida genom bo'yicha xaritani qurish.
Styuart EA va boshqalar. Genom Res 1997 May 7: 5 422-33. Inson genomining STS asosidagi radiatsiya gibrid xaritasi.

Dedifferentsiatsiyalangan gepatoma hujayralari ajratilishi mumkin va ular jigarga xos genlarni o'chiradi.
Deschatrette, J. va M.C. Vays. 1975. Differentsiallangan va dedifferentsiallangan kalamush gepatom hujayralari o'rtasidagi duragaylarda jigarga xos funktsiyalarning yo'qolishi. Somatik hujayra genetikasi. 1: 279-292

Yo'q bo'lib ketish ikki tomonlama ko'cha bo'lishi mumkin
Fujer, C. va M.C. Vays. 1978. Sichqoncha melanoma-kalamush gepatoma gibrid hujayralarida fenotipik istisno: pigment va albumin ishlab chiqarish bir vaqtning o'zida qayta ifodalanmaydi.

Jigarga xos genlarning yo'q bo'lib ketishi yuqori darajadagi protein kinaz A katalitik faolligi tufayli sodir bo'lishi mumkin.
Jons KW, Shapero MH, Chevrette M, Fournier RE. Hujayra 1991 yil 666-sentabr (5): 861-872. To'qimalarga xos o'chirgichni subtractiv gibridizatsiya klonlash: TSE1 protein kinaz A ning tartibga soluvchi bo'linmasini kodlaydi.
va
Boshart M, Weih F, Nichols M, Schutz G. Cell 1991 Sep 666(5):849-859 To'qimalarga xos o't o'chiruvchi TSE1 lokusu cAMPga bog'liq protein kinazning tartibga soluvchi bo'linmasini kodlaydi.

Yo'q bo'lib ketish ko'plab transkripsiya omillariga ta'sir qiladi.
Nitsch, D., M. Boshart va G. Shuts. 1993. Somatik hujayra duragaylarida tirozin aminotransferaza gen faolligining yo'q bo'lib ketishi bir nechta muhim transkripsiya faollashtiruvchilarining modifikatsiyasi va yo'qolishini o'z ichiga oladi. Genlar va Devel. 7: 308-319

Jigarga xos transkripsiya omillarining yo'q bo'lib ketishi
Bulla GA. Nuklein kislotalari Res 1997 iyun 1525 (12): 2501-2508. Gepatotsit yadro omili-4 gepatoma x fibroblast hujayra duragaylarida gepatotsit yadro omili-1 ifodasini o'chirishni oldini oladi.

Tanlanadigan transgen bilan o'rganilgan jigarga xos genlarning yo'q bo'lib ketishi
Keherly MJ, Hsieh CC, McCombs JL, Merryman LS, Papaconstantinou, J., Somat Cell Mol Genet 1996. 22 (2): 119-134. AFP, albumin va AFP-HPRT transgenining yo'q bo'lib ketishini ko'rsatadigan somatik hujayra duragaylarining xarakteristikasi.

Biologiya G4054y 5-hafta, 2000 yil 17-fevral

Ma'ruza mavzusi: Transfeksiya va genlarni ko'chirish

CaPO4, elektroporatsiya, lipofeksiya
Sitoplazmani bosib o'tishi kerak. Lizosomalarning ko'p qismini qamrab oladi. Lizosomal funktsiyani inhibe qilish ko'pincha yordam beradi (xlorokin)
Pechelosoma
2000 KB kointegratsiya (Robins)
Alohida transfektsiyalar -> alohida joylar
Tasodifiy yoki yarim tasodifiy (ko'p) integratsiya saytlari (agar maqsadli bo'lmasa)
Kam gomologik rekombinatsiya (keyingi hafta o'qishga kirish)
Qarang. xamirturush: 50% gomologik rec'n, 1/100 DNK. Shunday qilib, agar noqonuniy rekombinatsiya soxta saytlarga mutanosib bo'lsa, sutemizuvchilar hujayralarida 50%/100 = 0,5% gomologik bo'lishini kuting (

nima olasiz).
Vaqtinchalik transfeksiya doimiy va doimiy: klonlangan genlar -> 10-50% vaqtinchalik (bo'yoq)
Permanentlar 0,001 ga o'xshaydi (har bir hujayra uchun ?g DNK). ya'ni 106 -> 1000 koloniya
Umumiy DNKdan gen transfeksiyasining eng dramatik birinchi qo'llanilishi: o'sish bilan o'zgartirilgan fenotipning o'tkazilishi: ko'p qatlamlarda yoki yumshoq agarda suspenziyada o'sish qobiliyati: (Vaynberg, Wigler)
O'simtadan olingan DNK o'sish nazorati ostida sichqonchaning 3T3 hujayralariga o'tkazildi. Fokuslarni qidiring (fokus).
O'sish bilan o'zgartirilgan transfektantdan kutubxona yarating.
Inson Alu takrorlash uchun ekran.
Klonlangan DNK fokus hosil qiluvchi transfektantlarning yuqori chastotasini berishiga ishonch hosil qiling.
Gibridizatsiya yo'li bilan cDNKni ajratib oling.
Ketma-ketlik.
Genni aniqlang: = dominant onkogen. Ras, signalizatsiya oqsili (o'sish omillarini sezish uchun transduktsiya yo'lida).

Va endi: genlarni qo'shing, hujayra hosil qiling. Sichqoncha yasang.

O'qish keyingi safar muhokama qilinadi:

1. Bitta aniqlangan genning birinchi DNK o'tkazilishi
Wigler, M., Silverstein, S., Li, L.-S., Pellicer, A., Cheng, Y.-C. va Axel, R. 1977. Hujayra 11: 223-232. Tozalangan herpes virusi timidin kinaz genini madaniyatli sichqon hujayralariga o'tkazish.

2. Umumiy genomik DNK dan bitta aniqlangan genning birinchi yaxshi xarakterli transferi
Wigler M. Pellicer A. Silverstein S. Axel R. 1978. Donor sifatida umumiy hujayra DNKsidan foydalangan holda bir nusxadagi eukaryotik genlarning biokimyoviy o'tkazilishi. Hujayra. 14: 725-31.

3. Retroviruslar sutemizuvchilar hujayralariga gen o'tkazish uchun vektor sifatida.
Whitehead I, Kirk H, Kay R. Mol Cell Biol 1995 Fev15 (2): 704-710. cDNK kutubxonalarini retrovirus orqali o'tkazish orqali onkogenlarni ekspression klonlash.

4. Funktsiyani tanlash orqali genni klonlash uchun murakkabroq tanlov
Evans, C.J., D.E. Kit, Jr., X. Morrison, K. Mogandzo va R.H. Edvards. 1992. Delta opioid retseptorlarini funktsional ifodalash orqali klonlash. Fan 258: 1952-1955.

Qo'shimcha takliflar:

Aniqlangan genning sutemizuvchilar hujayralariga barqaror o'tkazilishini takomillashtirish va tavsiflash
Pellicer A. Wigler M. Axel R. Silverstein S. 1978. HSV timidin kinaz genini sichqoncha hujayralariga o'tkazish va barqaror integratsiyalashuvi Hujayra. 14:133-41.

Funktsiyani tanlash yo'li bilan klonlangan birinchi hujayra genlaridan biri
Lowy, I., A. Pellicer, J.F. Jekson, G-K. Sim, S. Silversteyn va R. Axel. 1980. Transformatsiya qiluvchi DNKning izolyatsiyasi: hamster aprt genini klonlash. 22-uya: 817-823.

Adenovirus gen uzatish vektori sifatida: Zhao H, Ivic L, Otaki JM, Hashimoto M, Mikoshiba K, Firestein S. Science 1998 Jan 9279 (5348): 237-24. Sutemizuvchilarning hidli retseptorlarining funktsional ifodasi.

Biologiya G4054y 6-hafta, 2000-yil 24-fevral

Rekombinatsiya genini nishonga olish
Gomologik bo'lmagan va gomologik rekombinatsiya
Gomologik xromosomalar orasidagi mitotik rekombinatsiya
O'smani bostiruvchi genlarni yo'qotish orqali saraton kasalligiga aloqasi
(heterozigotlikni (LOH) (Kavanee) yo'qotishiga olib keladigan rekombinatsiya orqali niqoblangan).
Transfektsion genlarning rekombinatsiyasi: gomologik va homolog bo'lmagan rekombinatsiya.
Gen konvertatsiyasi va o'zaro rekombinatsiya.
Misol: tandem qo'shimchalar orasidagi rekombinatsiya (Liskay)
Gomologik rekombinatsiya orqali gen nokautlari.
ES hujayralari va transgen sichqonlar.
Virusli TK genini yo'qotish orqali gomologik rekombinantlarni tanlash (keyingi safar Capecchi qog'ozi muhokama qilinadi)
Madaniy hujayra liniyalarida allellarni almashtirish. Misol: APRT genini almashtirish (Adair)
Pozitsiya effektlari. Chegara elementlari. SAR/MAR.

Keyingi safar muhokama qilinadigan o'qish:
1. Gomologik bo'lmagan rekombinantlarga qarshi va shuning uchun genlarni nishonga olish uchun tanlash.
Mansour SL, Thomas KR va Capecchi MR.1988. Sichqoncha embrionidan olingan ildiz hujayralarida proto-onkogen int2 ning buzilishi: tanlanmaydigan genlarga mutatsiyalarni yo'naltirishning umumiy strategiyasi. Tabiat 336:348-52

2. Yuqori darajadagi gomologik rekombinatsiyani ko'rsatadigan tovuq hujayralari chizig'idagi splaycing genining KO.
Vang J, Takagaki Y, Manley JL Genes Dev 1996 yil 1510 oktyabr (20): 2588-2599 Muhim umurtqali genning maqsadli buzilishi: ASF/SF2 hujayra hayotiyligi uchun zarur.

3. Insertion mutagenez orqali yangi genlarni topish
Fridrix G, Soriano P. Genes Dev. 1991 yil 5 (9): 1513-23. Embrion ildiz hujayralarida promoter tuzoqlari: sichqonlarda rivojlanish genlarini aniqlash va mutatsiya qilish uchun genetik ekran.

4. Saytga xos integratsiya.
Fukushige S, Sauer B. Proc Natl Acad Sci U S A 1992 yil 189 (17): 7905-9 Ijobiy tanlovli lox integratsiya vektori bilan genomik maqsadlilik sutemizuvchilar hujayralarida yuqori darajada takrorlanadigan gen ekspressiyasiga imkon beradi.

Mahalliy xromatin strukturasining transfektsion genlarga ta'siri va aksincha
Pikaart, M., Feng, J.A.U. va Villeponteau, B. 1992. Poliomavirus kuchaytirgichi HPRT geniga integratsiyalashganda xromatinning mavjudligini faollashtiradi. Molekulyar va uyali biologiya 12:5785-92

Integratsiyalashgan transgendagi mutatsiyaga gen pozitsiyasining ta'siri
Lichtenauer-Kaligis, E.G., van der Velde-van Deyke, I., den Dulk, X., van de Putte, P., Giphart-Gassler, M., Tasseron-de Jong, J.G. 1993. Genomik joylashuv mutagenez uchun maqsad sifatida hprt cDNKni o'z ichiga olgan integratsiyalangan retrovirus vektorning spontan mutageneziga ta'sir qiladi. Inson molekulyar genetikasi 2:173-82

Lichtenauer-Kaligis EG, Thijssen J, den Dulk H, van de Putte P, Tasseron-de Jong JG, Giphart-Gassler M. Endojen hprt genidagi nukleotidlar ketma-ketligi darajasida spontan hprt mutatsion spektrlarini va beshta boshqa genomik pozitsiyalarni taqqoslash. Mutat Res 1996 351:147-155.

Lavozim mustaqilligini ta'minlovchi Cis-ta'sir qiluvchi elementlar
Talbot, D., Descombes, P., Schibler, U. 1994. Sichqoncha LAP (C/EBP beta) genining 5' yonma-yon mintaqasi bir nechta to'qimalarda yuqori darajadagi, pozitsiyadan mustaqil, nusxa ko'chirish soniga bog'liq ifodani yo'naltirishi mumkin. transgen sichqonlarda. Nuklein kislotalari tadqiqoti 22:756-66

K.O. 2 oktyabrda Ig genini ifodalashga imkon beradi, lekin sun'iy kuchaytirgichlarning ta'sirini kamaytiradi. Feldhaus AL, Klug CA, Arvin KL, Singh H. EMBO J 1993 7:2763-72. B hujayradagi oktabr-2 lokusuning maqsadli buzilishi oktamer elementi vositachiligida gen faollashuvining ikki xil hujayra turiga xos yo'llari uchun genetik dalillarni beradi.

Biologiya G4054y 7-hafta, 2000-yil 2-mart

Saraton hujayralari genetikasi
Onkogenlar va protoonkogenlar
Dominant onkogenlar va o'smalarni bostiruvchi genlar
Retinoblastoma (Knudson)
Hujayra aylanishini nazorat qilish
Genetik beqarorlik va saratonga moyillik

O'qish keyingi safar muhokama qilinadi

1. Co'simta bostiruvchilarning lassic original molekulyar genetik tahlili
Cavenee, W.K., Dryja, T.P., Phillips, R.A., Benedict, W.F., Godbout, R., Gallie, B.L., Murphree, A.L., Strong, L.C. va White, R.L. 1983. Resessiv allellarning xromosomali mexanizmlar bilan ifodalanishi. Tabiat. 305: 779-84

2. DNK ta'miriga ta'sir qiluvchi mutatsiyalar saratonga moyillikni keltirib chiqaradi
Leach va boshqalar, 1993. Irsiy bo'lmagan kolorektal saratonda mutS homologining mutatsiyalari. 75-uya: 1215-1225.

3. Shishlarda global genomik beqarorlik
Stoler DL, Chen N, Basik M, Kahlenberg MS, Rodriguez-Bigas MA, Petrelli NJ, Anderson GR. Sporadik kolorektal shish rivojlanishida genomik beqarorlikning boshlanishi va darajasi. Proc Natl Acad Sci USA (1999) 96:15121-6

4. O'sma mutatsiyalari va o'sma evolyutsiyasi
Cahill DP, Kinzler KW, Vogelstein B, Lengauer C. Trends Cell Biol 1999 Dec9(12):M57-60. O'smalarda genetik beqarorlik va darvin tanlovi.

p53 vositachiligida o'sishni inhibe qilishga chidamli mutantlarni tanlash.
Jennifer A. Pietenpol, Kristof Lengauer, Yan Jordan, Kennet V. Kinzler, Bert Vogelshteyn. Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 93-jild: 8390-8394. Sutemizuvchilar hujayralari o'simta bostiruvchi genlarga chidamli.

Yo'g'on ichak saratoni bilan bog'liq tuzatish etishmovchiligining biokimyoviy asoslari
Parsons, R., Li, G.-M., Longely, MJ, Fang, V., Papadopulos, N., Jen, J., de la Chapelle, A., Kinzler, KW, Vogelstein, B. va Modrich , P. 1993. RER + o'simta hujayralarida hipermutabilite va mos kelmaslik tuzatish etishmovchiligi. 75-uya: 1227-1236.

Hech qanday genetik beqarorlik sichqonlarda polioma keltirib chiqaradigan o'smalar bilan bog'liq emas (trendga qarshi).
Jakubczak JL, Merlino G, frantsuz JE, Muller WJ, Paul B, Adhya S, Garges S. Proc Natl Acad Sci U S A 1996. 93 (17): 9073-9078. Bakteriofag lambda transgen nishonida in vivo mutatsiyalar uchun yangi tanlov asosidagi tahlil yordamida sut bezlari o'simtasining rivojlanishidagi genetik beqarorlikni tahlil qilish.

Inson kasalligi bilan bog'liq saratonga sezuvchanlik va DNKni tiklash genini ajratish
Morgan SE, Lovly C, Pandita TK, Shiloh Y, Kastan. Mol Cell Biol 1997 yil 17 aprel: 2020-2029 Dominant-salbiy yoki to'ldiruvchi faollikka ega bo'lgan ATM fragmentlari (ataksiya-telangiektaziya geni).

Biologiya G4054y 8-hafta, 9-mart, 2000-yil

O'qish topshirig'i yo'q, keyingi yig'ilish (23 mart) bo'yicha tajriba o'tkazishni taklif qiluvchi qog'oz.

Keyingi safar taqdim etiladigan hujjatlarni ko'rib chiqishingiz mumkin:

Devid Filds
Telomeraza qayta ko'rib chiqildi
Hahn WC, Counter CM, Lundberg AS, Beijersbergen RL, Brooks MW, Weinberg
RA. Tabiat 1999 yil iyul 29400 (6743): 464-8. Belgilangan genetik elementlar bilan inson o'simta hujayralarini yaratish.

Den Krossman
Immunoglobulin genining gipermutatsiyasi
Storb U, Klotz EL, Hackett Jr, Kage K, Bozek G, Martin TE. Immunoglobulin transgenidagi gipermutativ qo'shimchada RNK transkriptida yuqori barqaror tuzilmalarni bashorat qiluvchi somatik mutatsiya va ketma-ketliklarning faol nuqtalari mavjud. J Exp Med 1998 avgust 17188 (4): 689-98

Genni kuchaytirish (ushbu mavzu bo'yicha o'qish tayinlanmagan) (Internetdagi kengroq eslatmalarga qarang)
Tarixiy jihatdan: Metotreksat qarshiligi (Littlefield): Yuqori dihidrofolat reduktaza (DHFR) ferment faolligi, oqsil, oqsil sintez tezligi, tarjima qilinadigan mRNK. (Schimke): mRNK darajasi, DNK darajasi.
Bir hil bo'yalgan, kengaygan xromosoma hududlari (HSR): Biedler
Nunberg: = dhfr genlari.
Ikki daqiqali xromosomalar.
Amplikonlar.
Modellar: ortiqcha replikatsiya, teng bo'lmagan opa-singil xromatid almashinuvi. Ikkinchisi qo'llab-quvvatlanadi.
Genni kuchaytirish va genetik beqarorlik.
Tltsy: oddiy hujayralar p53-hujayralari kuchaytirmaydi.
Tabiatda: oositlarda rDNK, Drosophila chorion genlari.
Tibbiyotda: kemoterapiyaga chidamlilik saratoni: neyroblastomada N-src.
Biotexnologiyada: sutemizuvchilar hujayralarida yuqori darajadagi rekombinant oqsil ishlab chiqarish.

Genlarni kuchaytirish bo'yicha o'qishlar:

Erta genlarni kuchaytirish hodisalari bilan birga keladigan o'zgarishlarni sitogenetik o'rganish
Trask, B.J. va Hamlin, J.L. 1989. CHO hujayralarida erta dihidrofolat reduktaza genini kuchaytirish hodisalari odatda asl joylashuv bilan bir xil xromosoma qo'lida sodir bo'ladi. Genlar va rivojlanish. 3: 1913-25 (№ 2 uchun fon).
va
Ma, C., Martin, S., Trask, B., Hamlin, J.L. 1993. Opa-singil xromatid sintezi Xitoy hamster hujayralarida dihidrofolat reduktaza genini kuchaytirishni boshlaydi. Genlar va rivojlanish 7: 605-20.

Genning kuchayishi faqat genetik jihatdan beqaror o'simta hujayralarida sodir bo'ladi
Tlsty, T.D. 1990. Oddiy diploid odam va kemiruvchilar hujayralarida genlarni kuchaytirishning aniq chastotasi yo'q. Proc. Natl. akad. Sci. AQSH 87: 3132-6, 1990 (#4 uchun fon).

Genning kuchayishi p53 tomonidan bostiriladi
Livingstone, L.R., White, A., Sprouse, J., Livanos, E., Jacks, T., and Tlsty, T.D .1992. Hujayra siklini to'xtatish va genlarni kuchaytirish potentsialining o'zgarishi yovvoyi turdagi p53 yo'qolishi bilan birga keladi. 70-uya: 923-35.

Dori-darmonlarga chidamliligini ko'rsatadigan klassik qog'oz genlarning kuchayishi tufayli yuzaga kelishi mumkin
Alt FW, Kellems RE, Bertino JR, Schimke RT J Biol Chem 1978: 253: 1357-1370 Madaniy sichqon hujayralarining metotreksatga chidamli variantlarida dihidrofolat reduktaza genlarini tanlab ko'paytirish.

Transfektsion genlarning birgalikda kuchaytirilishining klassik namoyishi
Wigler, M., Perucho, M., Kurtz, D., Dana, S., Pellicer, A., Axel, R, Silverstein, S. Proc Natl Acad Sci USA 1980.77: 3567-3570 Sutemizuvchilar hujayralarining kuchaytirilishi mumkin bo'lgan transformatsiyasi dominant ta'sir qiluvchi gen.

Yuqori darajadagi rekombinant oqsil ishlab chiqarish uchun transfektsion genlarni birgalikda kuchaytirish
Page MJ, Sydenham MA. Biotexnologiya (1991) 9:64-68 Xitoy hamster tuxumdon hujayralarida insoniylashtirilgan monoklonal antikor Camppath-1Hning yuqori darajadagi ifodasi.

Biologiya G4054y 9-hafta, 2000 yil 23 mart. Mutant hujayralarni izolyatsiyasi: qiziqarli fenotiplarga misollar

Devid Filds
Telomeraza qayta ko'rib chiqildi
Hahn WC, Counter CM, Lundberg AS, Beijersbergen RL, Brooks MW, Weinberg
RA. Tabiat 1999 yil iyul 29400 (6743): 464-8. Belgilangan genetik elementlar bilan inson o'simta hujayralarini yaratish.

Den Krossman
Immunoglobulin genining gipermutatsiyasi
Storb U, Klotz EL, Hackett Jr, Kage K, Bozek G, Martin TE. Immunoglobulin transgenidagi gipermutativ qo'shimchada RNK transkriptida yuqori barqaror tuzilmalarni bashorat qiluvchi somatik mutatsiya va ketma-ketliklarning faol nuqtalari mavjud. J Exp Med 1998 avgust 17188 (4): 689-98

Ma'ruza: ba'zi qiziqarli mutantlarga misollar

Retseptorlar: LDL, aril uglevodorod gidroksilaza (politsiklik aromatik uglevodorodlarga chidamli)
Signalning uzatilishi: siklik AMP (chidamli: tartibga soluvchi sub birlik Km, katalitik subunit-salbiy)
interferon (keyingi safar muhokama qilinadi)
Biosintezni tartibga solish: xolesterin (keyingi safar muhokama qilinadi)
Transkripsiyani tartibga solish: glyukokortikoid retseptorlari (deksametazonga chidamli limfoid hujayralar)
Organellalar biogenezi: peroksisomalar (piren-alkogolga chidamli), mitoxondriyalar (Attardi)
Cis-ta'sir qiluvchi mRNKdan oldingi birlashuvchi mutatsiyalar (tabiiy gen manfiy transgenni qotil ekson bilan skrining)

Keyingi safar muhokama qilinadigan o'qish: 1. Interferon-javob signalini uzatish yo'lidagi mutantlar uchun aqlli push-pull ikki tomonlama tanlov
Pellegrini, S. va boshqalar. 1989. Signal yo'lida mutatsiyalarni olish uchun interferon bilan tartibga solinadigan tanlanadigan markerdan foydalanish Mol. Hujayra. Biol. 9: 4605-4612. ( Ueyn Devonish)

2. Metabolik yo'l mutantlari ta'sirlangan n tartibga soluvchi genlarni o'z ichiga oladi
Rawson RB, Cheng D, Brown MS, Goldstein JL J Biol Chem 1998 273:28261-9. Xolesterinni talab qiluvchi mutant xitoy hamster tuxumdon hujayralarini 1-saytda sterolni tartibga soluvchi elementni bog'lovchi oqsillarni parchalashda nuqsonlar bilan izolyatsiya qilish.( Jinshi Shen)

3. Dihidrofolat reduktaza fermenti manfiy mutantlarini tanlashda ko‘plab qo‘shilish mutantlari hosil bo‘ladi.
Carothers, A.M., G. Urlaub, D. Grunberger va L.A. Chasin. 1993. Xitoy hamster tuxumdon hujayralarida dihidrofolat reduktaza lokusuda qo'shilgan mutantlar va ularning ikkinchi joy bostiruvchilari. Mol. Hujayra. Biol. 13: 5085-5098.

4. Sis-ta'sir qiluvchi splaycing mutatsiyalarini aniqlash uchun ishlab chiqilgan genni o'rnatish
Chen, I-T. va L.A. Chasin. 1993. Hamster dihidrofolat reduktaza minigenidagi o'ziga xos qo'shilish joylariga ta'sir qiluvchi mutatsiyalar uchun to'g'ridan-to'g'ri tanlash. Mol. Hujayra. Biol. 13: 289-300. Qo'shimcha taklif:

Interferon-javob signalini uzatish yo'lida tanlangan mutantlarning xarakteristikasi
Leung, S.A., Qureshi, S.A., Kerr, I.M., Darnell, J.E. Jr., Stark, G.R. 1995. STAT2 ning alfa interferon signalizatsiya yo'lidagi roli. Molekulyar va uyali biologiya 15:1312-7

Hprt fermenti manfiy mutantlarini tanlash ko'plab birlashtiruvchi mutantlarni beradi
Steingrimsdottir, X., G. Rouli, G. Dorado, J. Koul va A.R. Lemann. 1992. Insonning gipoksantin guanin fosforiboziltransferaza genida splaynsiyani o'zgartiruvchi mutatsiyalar. Nuklein kislotalari Res. 20: 1201-1208.

Peroksisoma hosil bo'lishida nuqsonli mutantlarni ajratish va tavsiflash
Tateishi K, Okumoto K, Shimozawa N, Tsukamoto T, Osumi T, Suzuki Y, Kondo, N, Okano I, Fujiki. Peroksisoma biogenezida nuqsonli yangi aniqlangan xitoylik hamster tuxumdon hujayrasi mutantlari sutemizuvchilarda ikkita yangi komplementatsiya guruhini ifodalaydi. Eur J Cell Biol 1997 Avgust 73:4 352-9

Xolesterin almashinuvi mutantlarining izolyatsiyasi va tavsifi: bir nechta turlardan biri
Jacobs NL, Andemariam B, Underwood KW, Panchalingam K, Sternberg D, Kielian M, Liscum L. J Lipid Res 1997 Oct38(10):1973-1987 Xolesterolni plazma membranasidan nuqsonli mobilizatsiyasi bilan xitoylik hamster tuxumdon hujayrasi mutantining tahlili endoplazmatik retikulumga.

TGF-beta yo'li mutantlari yuqoridagi interferon yo'li mutantlariga o'xshash tarzda ajratilgan.
Xocevar BA, Howe PH. Proc Natl Acad Sci US A 1996 iyul 2393 (15): 7655-7660. O'sish omili beta signalizatsiyasini o'zgartirishda nuqsonli mutant hujayra liniyalarining izolyatsiyasi va tavsifi.

Yuqoridagi interferon-javob mutantlari tomonidan tekshirilgan JAK/STAT yo'lini ko'rib chiqish.
Briscoe J, Guschin D, Rogers NC, Watling D, Muller M, Horn F, Heinrich P, Stark GR, Kerr I. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 1996 fevral 29351 (1336): 167-171. JAKs, STATs va interferonlarga va boshqa sitokinlarga javoban signal uzatish.

Biologiya G4054y. 10-hafta. 2000 yil 30 mart

Transkripsiyani tartibga solish yoki signal uzatishda ta'sirlangan qiziqarli hujayra mutantlarini izolyatsiya qilish:

Ueyn Devonish
10A. Pellegrini S, Jon J, Shearer M, Kerr IM, Stark GR, Mol Cell Biol 1989. 9: 4605-4612. Signal yo'lidagi mutatsiyalarni olish uchun alfa interferon bilan tartibga solinadigan tanlanadigan markerdan foydalanish.

Jinshi Shen
10B. Rawson RB, Cheng D, Brown MS, Goldstein JL J Biol Chem 1998 273:28261-9. Xolesterinni talab qiluvchi mutant xitoy hamster tuxumdon hujayralarini 1-saytda sterolni tartibga soluvchi elementni bog'lovchi oqsillarni parchalashda nuqsonlar bilan izolyatsiya qilish.

Keyingi safar muhokama qilinadigan o'qish:

Transfeksiya orqali gen identifikatsiyasi: mushak hujayralari differentsiatsiyasining triggerlari

1. Transfeksiya natijasida kelib chiqqan fenotipik o'zgarish orqali myod genini aniqlash
Davis RL. Weintraub H. Lassar AB. 1987. Yagona transfektsion cDNKning ifodalanishi fibroblastlarni mioblastlarga aylantiradi. 51-uya: 987-1000.

2. Mushak o'smalari hujayralarida differentsiatsiyani tartibga solishning sutemizuvchilar hujayralarining genetik tavsifi
Fiddler TA, Smit L, Tapskott SJ, Thayer MJ. 1996. MDM2 ning kuchaytirilishi MyoD vositachiligidagi miyogenezni inhibe qiladi. Mol Cell Biol 16: 5048-57

3. Transfektantlarda miyogen differensiatsiyani qo'zg'atishi mumkin bo'lgan omillarni tanlash ajablantiradi.
Rastinejad, F. va H.M. Blau. 1993. Genetik komplementatsiya o'sish va differentsiatsiyada 3' tarjima qilinmagan mintaqalar uchun yangi tartibga soluvchi rolni ochib beradi. Hujayra. 72:903-917.

Qo'shimcha takliflar:
Xuddi shu birinchi muallif tomonidan yuqoridagi 3' UTR tartibga soluvchi RNK qog'ozini kuzatish
Rastinejad F, Conboy MJ, Rando TA, Blau HM. 1993. Alfa-tropomiozinning 3' tarjima qilinmagan hududidan RNK tomonidan o'simtani bostirish. 75-uya: 1107-1117

MyoD harakatining yo'q bo'lib ketishini o'rganish
Thayer MJ. Weintraub H. 1990. Somatik hujayra duragaylarida miyogenezni faollashtirish va repressiya qilish: asosiy fibroblastlarda MyoD ning trans-salbiy regulyatsiyasi uchun dalillar. Hujayra 63:23-32

Biologiya G4054y. 11-hafta. 2000 yil 6 aprel

Transfeksiya orqali gen identifikatsiyasi

Taqdimotlar va muhokamalar:

1. Transfektsiya natijasida kelib chiqqan fenotipik o'zgarish orqali miyoD genini aniqlash
Davis RL. Weintraub H. Lassar AB. 1987. Bitta transfektsion cDNKning ifodalanishi fibroblastlarni mioblastlarga aylantiradi. 51-uya: 987-1000.

2. Mushak o'smalari hujayralarida differentsiatsiyani tartibga solishning sutemizuvchilar hujayralarining genetik tavsifi
Fiddler TA, Smit L, Tapskott SJ, Thayer MJ. 1996. MDM2 ning kuchaytirilishi MyoD vositachiligidagi miyogenezni inhibe qiladi. Mol Cell Biol 16: 5048-57

3. Transfektantlarda miogen differensiatsiyani qo'zg'atishi mumkin bo'lgan omillarni tanlash ajablantiradi.
Rastinejad, F. va H.M. Blau. 1993. Genetik komplementatsiya o'sish va differentsiatsiyada 3' tarjima qilinmagan mintaqalar uchun yangi tartibga soluvchi rolni ochib beradi. Hujayra. 72:903-917.

Transfektsiya vositasida fenotipik blokirovka (genetik bostiruvchi elementlarni tanlash)

Antisens cDNKlar + biologik yo'lni inhibe qilish uchun tanlov (Roninson)
Kesilgan sezgi cDNKlari xuddi shu tarzda ishlatilgan.
Shuningdek: Kimchi: interferonga qarshilik Beach: xamirturush

Keyingi safar muhokama qilish uchun o'qish: 1. Lambda genlari va E. coli yordamida tizimning maqsadga muvofiqligining juda qoniqarli namoyishi.
Holzmayer, T.A., Pestov, D.G., Roninson, I.B. 1992. Tasodifiy DNK fragmentlarini ekspressiv tanlash orqali dominant salbiy mutantlar va inhibitor antisens RNK ketma-ketliklarini izolyatsiya qilish. Nuklein kislotalari tadqiqoti 20:711-7

2. Xamirturushlardan misollar bilan umumiy genetik supressor strategiyasi.
Hannon GJ, Sun P, Carnero A, Xie LY, Maestro R, Conklin DS, Beach D. 1999. MaRX: sutemizuvchilar hujayralarida genetikaga yondashuv. Fan. 1999 yil fevral 19283 (5405): 1129-30.

3. Turli xil p53 asosidagi genetik bostiruvchi elementlar turli p53 funktsiyalarini bloklaydi.
Valeriya S. Ossovskaya, Ilya A. Mazo, Mixail V. Chernov, Olga B. Chernova, Zaklina Strezoska, Roman Kondratov, Jorj R. Stark, Peter M. Chumakov, Andrey V. Gudkov. AQSh Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari 93:10309-10314. Alohida p53 domenlarining aniq biologik ta'sirini aniqlash uchun genetik bostiruvchi elementlardan foydalanish. (Kristi MakKinni)

4. Genning kuchayishi p53 tomonidan bostiriladi
Livingstone, L.R., White, A., Sprouse, J., Livanos, E., Jacks, T., and Tlsty, T.D .1992. Hujayra siklini to'xtatish va genlarni kuchaytirish potentsialining o'zgarishi yovvoyi turdagi p53 yo'qolishi bilan birga keladi. 70-uya: 923-35.
( Ueyn Devonish)

Sutemizuvchilar hujayralariga qo'llash
Gudkov, A.V., Kazarov, A.R., Thimmapaya, R., Axenovich, S.A., Mazo, I.A. va Roninson, I.B. 1994. Sutemizuvchilar genlarini genetik supressor elementlarning ekspressiv tanlovi orqali klonlash: kinesinning dori qarshiligi va hujayra o'lmasligi bilan bog'lanishi. Proc. Natl. akad. Sci. AQSh 91:3744-8

P53 ning genetik bostiruvchi elementlar tomonidan bloklanishi va dori chidamliligi uchun tanlov
Gallagher WM, Cairney M, Schott B, Roninson IB, Brown R. Oncogene 1997 Jan 1614 (2): 185-193. Sisplatinga qarshilik ko'rsatadigan p53 genetik supressor elementlarini aniqlash

Interferon vositachiligida o'sishni inhibe qilishga qarshilik ko'rsatadigan antisens cDNK fragmentlarini tanlash
Deiss LP, Kimchi A. Science 1991 yil aprel 5252 (5002): 117-120. Tioredoksinni o'sishni inhibe qiluvchi signalning vositachisi sifatida aniqlash uchun ishlatiladigan genetik vosita.
Yuqoridagilarga amal qiling
Cohen O, Feinstein E, Kimchi A. EMBO J 1997 Mar 316 (5): 998-1008. DAP-kinaz Ca2+/kalmodulinga bog'liq, sitoskeletal bilan bog'liq bo'lgan protein kinaz bo'lib, uning katalitik faolligiga bog'liq bo'lgan hujayra o'limiga olib keladigan funktsiyalarga ega.

Roninson laboratoriyasining sutemizuvchilar hujayralariga yana bir ilovasi
Gudkov, A.V., Zelnick, C.R., Kazarov, A.R., Thimmapaya, R., Suttle, D.P., Beck, W.T. va Roninson, I.B. 1993. Inson topoizomeraz II cDNK dan topoizomeraz II-interaktiv sitotoksik dorilarga qarshilik ko'rsatadigan genetik supressor elementlarini izolyatsiya qilish. Proc. Natl. akad. Sci. AQSh 90:3231-5

Biologiya G4054y. 12-hafta. 2000 yil 13 aprel

Transfektsiya vositasida fenotipik blokirovka

Taqdimotlar va muhokamalar:

1. Lambda genlari va E. coli yordamida tizimning maqsadga muvofiqligining juda qoniqarli namoyishi.
Holzmayer, T.A., Pestov, D.G., Roninson, I.B. 1992. Tasodifiy DNK fragmentlarini ekspressiv tanlash orqali dominant salbiy mutantlar va inhibitor antisens RNK ketma-ketliklarini izolyatsiya qilish. Nuklein kislotalari tadqiqoti 20:711-7

2. Xamirturushlardan misollar bilan umumiy genetik supressor strategiyasi.
Hannon GJ, Sun P, Carnero A, Xie LY, Maestro R, Conklin DS, Beach D. 1999. MaRX: sutemizuvchilar hujayralarida genetikaga yondashuv. Fan. 1999 yil fevral 19283 (5405): 1129-30.

3. Turli xil p53 asosidagi genetik bostiruvchi elementlar turli p53 funktsiyalarini bloklaydi.
Valeriya S. Ossovskaya, Ilya A. Mazo, Mixail V. Chernov, Olga B. Chernova, Zaklina Strezoska, Roman Kondratov, Jorj R. Stark, Peter M. Chumakov, Andrey V. Gudkov. AQSh Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari 93:10309-10314. Alohida p53 domenlarining aniq biologik ta'sirini aniqlash uchun genetik bostiruvchi elementlardan foydalanish. (Kristi MakKinni)

4. Genning kuchayishi p53 tomonidan bostiriladi
Livingstone, L.R., White, A., Sprouse, J., Livanos, E., Jacks, T., and Tlsty, T.D .1992. Hujayra siklini to'xtatish va genlarni kuchaytirish potentsialining o'zgarishi yovvoyi turdagi p53 yo'qolishi bilan birga keladi. 70-uya: 923-35. (
Ueyn Devonish)

SELEX: nuklein kislotalar ketma-ketligi maqsadlarini tanlash

Ketma-ketlik maydoni
Protein ligandlari uchun tanlov
Kichik molekulalar ligandlari uchun tanlash
Ribozimlar uchun tanlov
In vivo SELEX
Genomik SELEX

Keyingi safar muhokama qilish uchun o'qing:

1. OIV Rev oqsili bilan eng yaxshi bog'langan RNK ketma-ketliklarini tanlash
Bartel DP, Zapp ML, Green MR, Szostak Cell 1991 yil 167-noyabr (3): 529-536. OIV-1 Rev regulyatsiyasi virusli RNKdagi Uotson-Krik bo'lmagan tayanch juftlarini tan olishni o'z ichiga oladi. (Igor Shuryak)

2. RNK ligatsiyasini katalizlay oladigan ketma-ketliklarni tanlash
Ekland EH, Szostak JW, Bartel DP. Fan 1995 yil iyul 21269(5222):364-370 Tasodifiy RNK ketma-ketliklaridan olingan strukturali murakkab va yuqori faol RNK ligazalari

3. Splicing kuchaytiruvchi ketma-ketlik uchun in vivo SELEX
Coulter LR, Landree MA, Cooper TA. Mol Cell Biol 1997 yil 17:4 2143-50 In vivo tanlov orqali ekzonik biriktiruvchi kuchaytirgichlarning yangi sinfini aniqlash.

Qo'shimcha takliflar
Genomik SELEX g'oyalari
Qo'shiqchi BS, Shtatland T, Brown D, Gold L. Nuklein kislotalari Res 1997 Fevral 1525 (4): 781-786. Genomik SELEX uchun kutubxonalar.
va
Gold L, Brown D, He Y, Shtatland T, Singer BS, Wu Y. Proc Natl Acad Sci U S A 1997 yil 794-yanvar (1):59-64. Oligonukleotid shakllaridan genomik SELEXgacha: yangi biologik tartibga soluvchi halqalar.

Biologiya G4054y. 13-hafta. 2000 yil 20 aprel

O'tgan hafta o'qilgan maqolalar muhokamasi:

1. OIV Rev oqsili bilan eng yaxshi bog'langan RNK ketma-ketliklarini tanlash
Bartel DP, Zapp ML, Green MR, Szostak Cell 1991 yil 167-noyabr (3): 529-536. OIV-1 Rev regulyatsiyasi virusli RNKdagi Uotson-Krik bo'lmagan tayanch juftlarini tan olishni o'z ichiga oladi. (Igor Shuryak)

2. RNK ligatsiyasini katalizlay oladigan ketma-ketliklarni tanlash
Ekland EH, Szostak JW, Bartel DP. Fan 1995 yil iyul 21269(5222):364-370 Tasodifiy RNK ketma-ketliklaridan olingan strukturali murakkab va yuqori faol RNK ligazalari

3. Splicing kuchaytiruvchi ketma-ketlik uchun in vivo SELEX
Coulter LR, Landree MA, Cooper TA. Mol Cell Biol 1997 yil 17:4 2143-50 In vivo tanlov orqali ekzonik biriktiruvchi kuchaytirgichlarning yangi sinfini aniqlash.

4. O'qish uchun tayinlanmagan:
Rawson va boshq.: Sterolni tartibga soluvchi elementni bog'laydigan protein saytining 1 parchalanish fermentini klonlash. (Jingshi Shen)

Mutagenez va mutant tahlilining yangi yo'nalishlari

Keyingi safar muhokama qilish uchun o'qing:

1. DNKni aralashtirish
Crameri A, Raillard SA, Bermudez E, Stemmer WP Nature 1998 39:288-91 Turli xil turlardan genlar oilasining DNK aralashuvi yo'naltirilgan evolyutsiyani tezlashtiradi. (Adam Meshel)

2. Mutant fenotiplarni DNK mikroarray tahlili bilan xarakterlash
Sudarsanam P, Iyer VR, Brown PO, Uinston F. Proc Natl Acad Sci U S A 2000 yil 2897 (7): 3364-3369. Saccharomyces snf/swi mutantlarining butun genom ifodasi tahlili
cerevisiae. (Devid Fields)

3. Genetik iz.
Laurent LC, Olsen MN, Crowley RA, Savilahti H, Brown PO. Odamning immunitet tanqisligi virusi 1-toifa genomining genetik izlari bilan funktsional tavsifi. J Virol. 2000 yil 74-mart (6): 2760-9.

Qo'shimcha tegishli hujjatlar:
Genetik izlar yordamida klonlangan genning yuqori aniqlikdagi funktsional xaritasi.
Proc Natl Acad Sci U S A. 1997 Fevral 1894 (4): 1304-9.

Smit V, Chou KN, Lashkari D, Botshteyn D, Brown PO. Xamirturush V xromosomasi genlarini genetik iz bilan funksional tahlil qilish.Fan. 1996 yil dekabr 20274 (5295): 2069-74.

Smit V, Botshteyn D, Brown PO. Genetik iz: genning ketma-ketligini hisobga olgan holda uning funktsiyasini aniqlash uchun genomik strategiya. Proc Natl Acad Sci US A. 1995 iyul 392 (14): 6479-83.

Goryshin IY, Miller JA, Kil YV, Lanzov VA, Reznikoff WS. Proc Natl Acad Sci U S A. 1998 95 (18): 10716-21. Tn5/IS50 maqsadni aniqlash.

Biologiya G4054y. 14-hafta. 2000 yil 27 aprel

Oxirgi dars, topshiriq yo'q.

Oxirgi marta topshirilgan hujjatlarni muhokama qilish.

1. DNKni aralashtirish
Crameri A, Raillard SA, Bermudez E, Stemmer WP Nature 1998 39:288-91 Turli turlardan genlar oilasining DNK aralashuvi yo'naltirilgan evolyutsiyani tezlashtiradi.- ( Adam Meshel)

2. Mutant fenotiplarni DNK mikroarray tahlili bilan xarakterlash
Sudarsanam P, Iyer VR, Brown PO, Uinston F. Proc Natl Acad Sci U S A 2000 yil 2897 (7): 3364-3369. Saccharomyces cerevisiae ning snf/swi mutantlarining butun genom ifodasi tahlili.

3. Genetik iz.
Laurent LC, Olsen MN, Crowley RA, Savilahti H, Brown PO. Odamning immunitet tanqisligi virusi 1-toifa genomining genetik izlari bilan funktsional tavsifi. J Virol. 2000 yil 74-mart (6): 2760-9.



Izohlar:

  1. Pontus

    It seems to me nishtyak!

  2. Tilton

    Siz nohaqsiz. Men o'z pozitsiyamni himoya qila olaman. Bosh vazirga elektron pochta orqali yuboring, biz gaplashamiz.

  3. Taye

    Bu - mumkin emas.

  4. Prescot

    Ha iste'dodlisiz :)

  5. Alvar

    Awesome



Xabar yozing