Ma `lumot

Ki va IC50 o'rtasidagi farq nima?

Ki va IC50 o'rtasidagi farq nima?



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Men yaqinda tadqiqot postida o'qidim: "IC50 qiymatidan eksperimental bog'langan erkin energiyani qanday hisoblash mumkin".

Men K. o'rtasidagi farq nima ekanligiga ishonchim komil emasi va IC50. Kimdir tushuntira oladimi?


Biokimyoda K.i kompleks va unga bog'langan molekulalarning dissotsilanish konstantasi. Bu ingibitorning funktsional kuchi o'lchovidir. Bu, masalan, ferment va uning substrati K bo'lishi mumkini kompleksning barqarorligini belgilaydi.

IC50 boshqa tomondan - biokimyoviy jarayonda moddaning yarimmaximal inhibitiv kontsentratsiyasi. Bu ferment inhibitori bo'lishi mumkin. Bu rasmga qarang (IC haqidagi Vikipediya maqolasidan50):

Ki ICni hisoblashda muhim rol o'ynaydi50, chunki u ferment-inhibitor kompleksining kuchini aniqlaydi.


Quvvat muammosi: IC50 dan KB yoki Ki ni aniqlash. Cheng-Prusoff tenglamasiga, Shild syujetiga va tegishli quvvat tenglamalariga yaqinroq nazar

Kirish: Cheng-Prusoff tenglamasi (1973) ko'pincha IC50 qiymati mavjud bo'lganda raqobatbardosh antagonistning muvozanat dissotsilanish konstantasini (KB) aniqlashda qo'llaniladi. Ushbu tadqiqotning maqsadi, agonist kontsentratsiyasi-javob egri chizig'ining qiyalik funktsiyasi (K) KB qiymatlarini aniqlashda hal qiluvchi ahamiyatga ega ekanligini ko'rsatishdir.

Usullari: Maqolada nishab funktsiyasini o'z ichiga olgan yangi tenglamalar tasvirlangan, natijada antagonistlar uchun KB qiymatlarini aniqroq baholash imkonini beradi va ularni simulyatsiya qilingan ma'lumotlardan foydalangan holda sinab ko'radi. KB qiymati quyidagi yangi kuch tenglamasi bo'yicha hisoblab chiqilgan: KB = IC50/(l + A (K)/Kp) = IC50/[l + (A/EC50) (K)], bu erda IC50 - konsentratsiyasi. 50% inhibisyon hosil qiluvchi antagonist, A - IC50 aniqlanadigan agonistning konsentratsiyasi va KP - agonistning ko'rinadigan muvozanat dissotsiatsiya konstantasi.

Natijalar: Yangi tenglama Cheng-Prusoff tenglamasi bilan bir xil bo'lib, agar qiyalik funksiyasi K aynan birlik bo'lsa. Tenglamani qo'llash, agar agonist kontsentratsiyasi-javob egri chizig'ining qiyalik funktsiyasi birlikdan chetga chiqsa, Cheng-Prusoff tenglamasidan foydalanishga xos bo'lgan xatolardan qochadi. Yangi tenglama birlikdan kichik, teng yoki undan kattaroq qiyalik funktsiyalari uchun qo'llanilgan. Barcha inhibisyon egri chiziqlari 1 ga teng manfiy qiyalik funksiyasiga ega, bu esa agonist kontsentratsiyasi-javob egri chiziqlarining turli qiyalik funksiyalari ishtirok etsa ham, faqat bitta retseptor populyatsiyasi mavjudligini ko'rsatadi. Quvvat funktsiyasining Schild syujetidagi ahamiyatini quyidagi tenglama yordamida ko'rsatish mumkin: log (x (K) - 1) = log B - log KB, bu erda x - konsentratsiya nisbati va B - antagonist kontsentratsiyasi.

Muhokama: Ushbu tadqiqot agonist kontsentratsiyasi-javob egri chizig'ining turli xil nishab funktsiyalari bo'lgan vaziyatlarni qamrab olgan KB qiymatlarini aniq baholash uchun oltita quvvat tenglamasini qo'llashni ko'rsatadi.


Ki, IC50 va inhibitor kontsentratsiyasiga asoslangan odamda dori-darmonlarning o'zaro ta'sirini sifat va miqdoriy baholash

CYP450 fermentlarining potentsial ingibitorlari sifatida yangi dori vositalarini skrining qilish uchun qo'llaniladigan strategiyalar hozirda giyohvand moddalarni aniqlash jarayonida nomzodlarni tanlashda keng qo'llaniladi. Biroq, IC50 qiymatlari asosida olingan ma'lumotlar, odatda, ko'proq sifatli xarakterga ega. Ushbu tadqiqotning maqsadi I/Ki (I inhibitori kontsentratsiyasiga to'g'ri keladi) nisbati asosida o'zaro ta'sir potentsialini ko'proq miqdoriy baholashga erishish mumkinligini aniqlashdan iborat edi. Ki qiymatlari, in vivo ma'lumotlar, ya'ni nazorat holatida plazma ta'siri va inhibitorlar mavjudligi, 36 birikma uchun adabiyotlardan olingan. Miqdoriy baholash uchun quyidagi ingibitorlar kontsentratsiyasi hisobga olindi: I max va I in, max (mos ravishda tizimli qon aylanishida va portal venada maksimal I), I max, u va I, max, u (mos ravishda, maksimal chegaralanmagan I) tizimli qon aylanishida va portal venada). Bashorat qilingan o'zaro ta'sir AUCinhibitor/AUCcontrol = 1 + I/Ki sifatida hisoblab chiqilgan, bu erda AUCcontrol va AUCinhibitor mos ravishda plazma kontsentratsiyasining egri chizig'idagi vaqt rejimiga va nazorat sharoitida (ya'ni inhibitorsiz) va ingibitor bilan ifodalanadi. I/Ki -dan foydalanish o'zaro ta'sir potentsialini ko'proq miqdoriy baholash imkonini berdi. Shu nuqtai nazardan, protein bilan bog'lanish DDI potentsialini ortiqcha baholamaslik uchun hisobga olinadigan asosiy parametr bo'lib chiqdi. Shunday qilib, I max,u/Ki nisbati asosida 60% muvaffaqiyatli bashoratlarga erishish mumkin edi. Shunga qaramay, in vivo DDI o'rtasidagi ba'zi katta burilishlar bu yondashuv yordamida qo'lga kiritildi va fm va fh kabi qo'shimcha parametrlar haqida ma'lumot bo'lmasa, ingibitorlar kontsentratsiyasining aloqadorligi va bog'lanish ta'siriga oid kuzatishlar juda ehtiyotkorlik bilan talqin qilinishi kerak. .


Tushuntirish

Agar klinisyenlar adabiyotlarda va dori-darmonlar uchun mahsulot qo'shimchalarida hali Ki ni uchratishni boshlamagan bo'lsalar, ular kelajakda ularga duch kelishlari mumkin.1-3 Ki qisman klinik ahamiyatga ega dori o'zaro ta'sirini bashorat qilishda muhim ahamiyatga ega bo'ladi.1, 3 Oddiy qilib aytganda, sitokrom P450 (CYP) fermentining inhibisyoniga olib keladigan ma'lum bo'lgan preparatning inhibitör konstantasi (Ki) va yarim maksimal inhibitiv kontsentratsiyasi (IC50) bu ferment faolligini pasaytirish uchun zarur bo'lgan konsentratsiyaga bog'liq. yarmiga. Aniqroq aytganda, Ki bog'lanish yaqinligini aks ettiradi va IC50 inhibitörün funktsional kuchini aks ettiradi, lekin ferment faolligini inhibe qiladigan dori konsentratsiyasining ikkala omili. Shunisi e'tiborga loyiqki, CYP fermentlarining raqobatbardosh bo'lmagan inhibitorlari bo'lgan dorilar uchun preparatning Ki qiymati IC50 ning raqamli qiymati bilan bir xil raqamli qiymatga ega, raqobatbardosh va raqobatbardosh bo'lmagan inhibisyon uchun esa Ki IC50 ning taxminan yarmini tashkil qiladi.3 Shuning uchun , Ki qanchalik kichik bo'lsa, bu fermentning faolligini inhibe qilish uchun kamroq miqdorda dori kerak bo'ladi.

Agar Ki odatdagi dozada bemorga ta'sir qiladigan maksimal plazma dori konsentratsiyasidan ancha katta bo'lsa, u holda bu preparat bu ferment faolligini inhibe qilmaydi. Bu ta'sir [I]/Ki nisbatida ham aks ettirilishi mumkin.1 Buning klinik jihatdan tegishli misolini sitokrom P-450 (CYP) 3A4 fermenti bo'yicha proton nasos inhibitörleri (PPI) uchun Ki ni baholash orqali ko'rish mumkin. Masalan, 2C219,4-9 ni keng metabolizatorlar yoki yomon metabolizatorlar bo'lgan bemorlarda ko'pchilik PPI (42 dan 51 mM gacha) Ki ning tegishli maksimal kontsentratsiyasidan (1 dan 5,2 mM gacha) sezilarli darajada yuqoridir, chunki PPI uchun Ki ning qiymati shunchalik yuqori. odatda dozalashda kuzatiladigan maksimal dori konsentratsiyasidan ancha yuqori, ko'pchilik PPIlar CYP3A4 faolligini inhibe qilmaydi.

Muayyan dori uchun Ki ni talqin qilish yoki ko'rib chiqishda tadqiqotdan olingan qiymatga bir necha omillar ta'sir qilishi ma'lum ekanligini tan olish ham muhimdir. Bu omillarga substratning o'ziga xosligi, inkubatsiya tizimidagi biriktiruvchi komponentlar va har qanday substrat yoki ingibitorlarning kamayishi kiradi.1 Inkubatsiya tizimiga taalluqli, ishlatiladigan biologik tizimga qarab, Ki o'zgarishi mumkin, natijada Ki diapazoni paydo bo'ladi. 4,10

Shuning uchun, Ki -dan foydalanish, ma'lum bir dori -darmonning ma'lum bir fermentni inhibe qilishini va natijada, ferment uchun substrat bilan dori -darmonlarning klinik jihatdan o'zaro ta'sirini keltirib chiqarishi ehtimolini aniqlashda yordam beradi. Ko'pgina hollarda, Ki ni organizmda mavjud bo'lgan inhibitor kontsentratsiyasiga nisbatan baholash allaqachon amalga oshirilgan va dasturlar yoki ma'lum dori-darmonlar haqida ma'lumot manbalari uchun ma'lum bir dori-darmonlarni inhibitor yoki yo'qligini xabar qilish uchun asos sifatida ishlatiladi. Klinisyenlar, shuningdek, barcha dori -darmonlar bozorga kelishiga qarab to'liq baholangan yoki bo'lmasligi mumkinligini ham tan olishlari kerak. Bunday hollarda yoki holatlarda, birgalikda qo'llaniladigan dorilar o'rtasida dori vositalarining o'zaro ta'siri ehtimolini aniqlashga harakat qilganda, klinisyenlar ushbu baholash usuliga murojaat qilishlari kerak.


METODLAR

Reaksiyalar va tenglamalar

(9) da keltirilgan veb -sayt bizning dizaynimizning boshlang'ich shabloni bo'lib xizmat qilgan TUSHUNARLI50-to-Ki konvertor. Tenglamalar (1–4) referlardan moslashtirilgan. (3), (6) va (9), biz bu tadqiqot uchun (5) tenglamani oldik. Uchun analitik ifodalar Ki Quyida ko'rsatilganlar oldingi kinetik tahlilda qo'llanilgan usullar bilan raqamli tasdiqlangan (10).

Konvertatsiya qilish uchun hosilalar TUSHUNARLI50 ga Ki Brandt tomonidan nashr etilgan qadriyatlar va boshqalar. (3) o'rtasida turli munosabatlar mavjud bo'lishi mumkin bo'lgan uchta turdagi klassik inhibitor mexanizmlarni o'z ichiga oladi S va Km. Qattiq bog'langan ingibitorlar uchun tenglama Ki Copeland tomonidan va boshqalar. (6) ingibitorlar bilan bog'langan turlarning katta miqdorini hisobga olish uchun ishlatiladi, shuning uchun Mayklis -Menten umumiy ferment konsentratsiyasi teng degan taxminni bekor qiladi (5). Bu tenglamalar oqsil -ligand -inhibitori (P -L -I) o'zaro ta'sirlari uchun ham tegishli bo'lib, ular ham yuqoridagi taxminlarga amal qiladi.


Mast hujayra degranulyatsiya qiluvchi peptid

Boshqa tadqiqotlar

TUSHUNARLI50 MCDP ning kalamush miyasining turli hududlarida [125 I] Kaliotoksin bilan bog'lanishi bilan raqobatlasha oladigan qiymatlari Bessone va uning hamkasblari Bessone va boshqalar (2004) tomonidan chop etilgan maqolada ko'rsatilgan.

Alomone Labs ( http://www.alomone.com/System/UpLoadFiles/DGallery/Docs/M-250.pdf ) yoki Sigma-Aldrich ( http://www.sigmaaldrich.com/cgi-bin/hsrun ) dan sotuvda mavjud /Suite7/Suite/Suite.hjxstart=Suite.HsViewHierarchy.run?Detail=Product&ProductNumber=SIGMA-M8036&VersionSequence=1).


Yod va kaliy yodid o'rtasidagi farq

I odin va kaliy yodid ko'pincha shunga o'xshash komponent tufayli bir-biri bilan aralashtiriladi: yod.

Kimyoviy tasnifi va tuzilishi jihatidan yod element, kaliy yodid esa kimyoviy birikma. Yod elementlarning davriy jadvalida 53 raqamiga ega. Boshqa ko'plab elementlar singari, yodning ham o'ziga xos atom og'irligi, o'ziga xos qaynash nuqtasi va bu element bilan bog'liq boshqa noyob ma'lumotlari bor.

Murakkab sifatida kaliy yodid kaliy va yodning birikmasidir. Bu elementlarning kimyoviy jihatdan birlashtirilganligini va ularning individual xususiyatlari barqaror holatda birlashtirilganligini anglatadi.

Kimyoviy moddalar sifatida ikkalasi ham kimyoviy formulalarda harflar bilan ifodalanadi va ko'plab tajribalarda ishlatiladi. Yodning belgisi - "I" harfi. Ayni paytda, kaliy yodidning belgisi "KI" (kaliy uchun "K" va yod uchun "I"). Kaliy yodidi yana noorganik birikma sifatida tasniflanadi.

Yod, element sifatida, inson ratsionida muhim ahamiyatga ega. U tuzda mavjud bo'lib, u tananing dietasiga, xususan, qalqonsimon bezlarga tegishli. Yod qalqonsimon bezlarga tiroksin gormonlarini ishlab chiqarishga yordam beradi.

Yod, o'z nomiga ko'ra, ko'k-qora rangdan binafsha ranggacha. U gazsimon holatda bo'ladi va boshqa element qo'shilishi bilan osonlikcha birikmalarga aylanadi. Yodning ikki turi mavjud: radioaktiv bo'lmagan (tabiiy) yoki radioaktiv (sintetik) yod.

Kaliy yodid - bu yodning kimyoviy shakllaridan biri natijasida hosil bo'lgan birikma. Yodning boshqa kimyoviy shakllariga yod va elementar yod kiradi. Yod yodning salbiy shaklidir.

Kaliy yodidi oq va tashqi ko'rinishida tiniq. Odatda qattiq, ko'pincha chang shaklida bo'ladi. Bu eng muhim yod birikmasi hisoblanadi.

Ularning orasidagi yana bir farq - ulardan foydalanish. Yod asosan yaralarni tozalash va suvni tozalash uchun dezinfektsiyalovchi va tozalash vositasi sifatida ishlatiladi. Insonning ovqatlanishi nuqtai nazaridan, yod qalqonsimon bezning tuzilishida muhim ahamiyatga ega.
Boshqa tomondan, kaliy yodidi yodlangan tuzni tayyorlash uchun va yod etishmasligi uchun qo'shimcha sifatida ishlatiladi. Bu, shuningdek, farmatsevtika tarkibiy qismidir, ayniqsa, radioaktiv ta'sirni oldini oladigan dorilar.


Xulosa

Yangi veb-server vositasi taxmin qilinmoqda Ki eksperimental tarzda aniqlangan qiymatlar TUSHUNARLI50 fermentlar ingibitorlari va makromolekulalar (masalan, oqsillar, polinuklein kislotalari) va ligandlar orasidagi bog'lanish reaktsiyalarining qiymatlari. Ushbu konvertor oxirgi foydalanuvchilarga inhibitorlar ta'sir mexanizmining turiga va o'zaro ta'sir qiluvchi molekulyar turlarning kontsentratsiyasiga bog'liq bo'lgan ushbu hisob -kitoblarda ishlatiladigan taxminlarning sifatini aniqlashga yordam berish uchun ishlab chiqilgan. Reaksiyaga kirishuvchi turlarning umumiy kontsentratsiyasi emas, balki erkin bo'lishi kerak bo'lgan ferment-substrat yoki makromolekulyar-ligand tizimlarining klassik bo'lmagan, mahkam bog'langan inhibitorlari uchun qo'shimcha hisob-kitoblar amalga oshiriladi. Foydalanuvchi tomonidan belgilangan kirish qiymatlari umumiy ferment (yoki boshqa maqsadli molekula) va substrat (yoki ligand) kontsentratsiyasini o'z ichiga oladi. Km ferment-substratning (yoki Kd maqsad-ligand) reaktsiyasi va TUSHUNARLI50 qiymat. Ushbu hisob-kitoblar uchun taxminlar va ogohlantirishlar adabiyotlardan olingan misollar bilan birga muhokama qilinadi. Ushbu konvertor uchun ma'lumotlar bazasida kinetik konstantalar va proteolitik klostridial neyrotoksinlar inhibitörleri uchun boshqa ma'lumotlar mavjud (http://botdb.abcc.ncifcrf.gov/toxin/kiConverter.jsp).


Inhibisyon doimiysi o'rtasidagi bog'liqlik (KMen) va 50 % inhibisyonga olib keladigan inhibitör konsentratsiyasi (Men50) fermentativ reaktsiya ☆

Inhibisyon konstantasi o'rtasidagi bog'liqlikni nazariy tahlil qilingan.KMen) moddaning va (Men50) ma'lum bir substrat konsentratsiyasida fermentativ reaktsiyaning 50% inhibisyonini hosil qilish uchun zarur bo'lgan inhibitor kontsentratsiyasini ifodalovchi qiymat. O'rtasidagi munosabatlar taqqoslandi KMen va Men50 raqobatbardosh yoki raqobatbardosh bo'lmagan inhibe kinetikasi qo'llanilganda monosubstratli reaktsiyalar uchun, shuningdek, raqobatbardosh, raqobatsiz va raqobatsiz inhibisyon kinetikasi sharoitida bisubstratli reaktsiyalar uchun. Dan bexosdan foydalanishga qarshi choralar ko'rsatildi Men50 adabiyotda ilgari tasvirlangan nasihatlarga muvofiq qadriyatlar. Ta'riflangan tahlil shuni ko'rsatadiki KMen teng kelmaydi Men50 raqobatbardosh inhibitiv kinetika qo'llanilganda, KMen ga teng Men50 raqobatbardosh bo'lmagan yoki raqobatbardosh bo'lmagan kinetika sharoitida.

Ushbu tadqiqot Amerika Qo'shma Shtatlari sog'liqni saqlash tadqiqotlari uchun Grant CA-05262 tomonidan qo'llab-quvvatlandi.


Potentsial noaniq vaziyat

Quyidagi grafik g'ayrioddiy holatni ko'rsatadi, bunda inhibisyon egri chizig'i standart preparatning yuqori konsentratsiyasi bilan belgilanadigan nazorat qiymatlaridan (NS) ancha yuqori bo'ladi. Bu IC50 ning muqobil ta'riflariga olib keladi.

Shubhasiz, bitta qiymat bunday egri chizig'ini umumlashtira olmaydi. Sizga kamida ikkita qiymat kerak bo'ladi, biri egri chiziqning o'rtasini (preparatning kuchi), ikkinchisi esa uning qanchalik past bo'lishini (preparatning maksimal ta'sirini) aniqlash uchun.

Yuqoridagi grafik IC50 ning ikkita ta'rifini ko'rsatadi.

Nisbiy IC50 odatda eng keng tarqalgan ta'rif bo'lib, odatda sifatdosh sifatdoshi qoldiriladi. Bu egri chiziqning yuqori va pastki platolari orasidagi yarmigacha egri chiziqni pastga tushirish uchun zarur bo'lgan kontsentratsiyadir. IC50 ta'rifi bilan NS qiymatlari umuman e'tiborga olinmaydi. Ushbu ta'rifga agonist va antagonistlarning o'zaro ta'sirining klassik farmakologik tahlili asoslanadi. O'zaro ta'sir o'tkazuvchi ligandlarning biologik tizimi va kontsentratsiyasini hisobga olgan holda, taxminiy Kd qiymatlari ko'pincha shu tarzda aniqlangan IC50 qiymatidan olinishi mumkin (quyida keltirilgan "mutlaq IC50" deb nomlanmagan).

Blank va NS qiymati o'rtasida javobni qo'zg'atadigan kontsentratsiya ba'zan mutlaq IC50 deb ataladi, Gorizontal nuqtali chiziqlar 100% va 0% qanday aniqlanganligini ko'rsatadi, keyin esa 50% ni belgilaydi. Bu atama umuman standart emas. Bu qiymat dorining kuchini aniqlamagani uchun, Xalqaro farmakologiya uyushmasi retseptorlari nomenklaturasi qo'mitasi mualliflari (1) mutlaq IC50 tushunchasi (va bu atama) foydali emas deb o'ylashadi (R. Neubig, shaxsiy muloqot) . Men roziman.

Hujayra o'sishini sekinlashtiradigan dori miqdorini aniqlash uchun kontseptsiya (lekin "mutlaq IC50" atamasi emas) ishlatiladi. GI50 qisqartmasi biz bu erda mutlaq IC50 deb ataydigan narsada ishlatiladi. Bundan tashqari, u Atrof-muhitni muhofaza qilish agentligi (EPK) tomonidan endokrin buzilishlarni baholashda qo'llaniladi (A ilovasi). Ushbu hujjat mutlaq IC50 ga murojaat qilish uchun IC50 atamasidan va nisbiy IC50 ga nisbatan EC50 atamasidan foydalanadi. U nisbiy va mutlaq atamalarni ishlatmaydi.

Mutlaq IC50, inhibitörün bog'lanishini yoki javobini 50%dan pastroq qilishini talab qiladi. Agar inhibitör faqat javobni 60% ga tushirsa, egri chiziq hech qachon Y = 50% chizig'ini kesib o'tmaydi, shuning uchun mutlaq IC50 aniqlanmagan.


Videoni tomosha qiling: 科研数据处理015 计算IC50 (Avgust 2022).